omavad kaitset koolera ja tüüfuse vastu. 19. Millest sõltub uute mutatsioonide fikseerumistõenäosus populatsioonis (nii neutraalsed kui ka valiku all olevad alleelid)? Agnes Positiivse valiku all olev uus mutatsioon fikseerub suurema tõenäosusega. Kui kasulik alleel on algselt madala sagedusega, siis võib see ikkagi kaduma minna. Valemi järgi saab öelda, et mutatsioonide fikseerumise tõenäosus sõltub selektsioonikoefitsiendist (s) ja populatsioonisuurusest (N). Kui alleel on kasulik, siis s>0 ja kui kahjulik siis s<0. Kui alleel on peaaegu neutraalne, siis nii valik kui ka populatsiooni suurus on olulised. Kui alleel on tugevalt kasulik, siis fikseerumise tõenäosus ei sõltu populatsiooni suurusest. Tugevalt kahjuliku alleeli fikseerumise tõenäosus on väga väike, kaheneb kiiresti 0-ni. 20. Millest sõltub neutraalsete / valiku all olevate alleelide asenduskiirus? Agnes
Igas põlvkonnas tekib 2Nμ uut alleeli ja fikseerumise tõenäosus on u(0,N) = 1/(2N), siis asenduskiirus on võrdne mutatsioonikiirusega: r(0,N) = μ ehk sõltub mutatsioonikiirusest. Valiku all olevate alleelide puhul: Igas põlvkonnas tekib 2Nμ uut alleeli ja fikseerumise tõenäosus on u(s,N) ning asenduskiirus on r(s,N) = 2Nμu(s,N) Neutraalsete alleelide asenduskiirus on võrdne mutatsiooni-kiirusega, valiku all olevate alleelide puhul sõltub ka selektsioonikoefitsiendist. 21. Mis on koodonikasutuse kallutatus? Kas see suurendab või vähendab neutraalsete positsioonide arvu? Miks? Mõnda koodonit kasutatakse mõnedel liikidel oluliselt rohkem kui teisi. Nii ongi koodonikasutus erinevatel liikidel erinev. Koodonikasutuse kallutatus vähendab tõeliselt neutraalsete saitide arvu. 22. Selgitage selective sweep’i nähtust. Mis on osaline sweep? Kas selective sweep suurendab või vähendab heterosügootsust valiku all oleva lookuse läheduses