Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma Referaat TARTU 2014 Sissejuhatus Esimene täielikult sekveneeritud genoom kuulub bakteriofaagile -X174. Edukas viirusegenoomi DNA järjestuse kindlaks tegemine kannustas ette võtma mahukamaid projekte ja üks kulukamaid nende seas on ,,Inimese genoomi projekt" (HGP, inglise keeles the Human Genome Project). Tänaseks on välja töötatud järgmise põlvkonna sekveneerimismeetodid (NGS, inglise keeles next-generation high-throughput sequencing), mis nõuavad üha vähem ajalisi ja rahalisi ressursse. Selline soodus olukord on vallandanud sekveneerimisbuumi, mis on tõstatanud uue probleemi mida teha saadud andmetega? Üha rohkem tuntakse vajadust sekveneeritud DNA järjestusi analüüsida ja tõlgendada. Paralleelselt sekveneerimismeetodite arenguga proovitakse välja töötada üha täiustatumaid programme andmete töötlemiseks
Reaktsioonid viiakse läbi iga lämmastikalust sisaldava nukleotiidiga eraldi: igas eri anumas on sama tähega lõppevad lõigud. Järjestuse paika panemiseks viiakse läbi geel-elektroforees. Kõik tekkinud DNA lõigud on erineva pikkusega ja see mõjutab nende liikumist geelis: lühemad lõigud liiguvad kaugemale, pikemad lähemale. Kuna on teada, millise tähega iga eri pikkusega lõik lõppeb, siis saab teada, kus milline täht sekveneeritavas DNAs paikneb. Järgmise põlvkonna sekveneerimismeetodid. Järgmise põlvkonna sekveneerimistehnoloogia pidi lahendama kõik Sangeri meetodil esinevad probleemid nagu nt kõrge hind ja suhteliselt vähese informatsiooni saamine. Seda iseloomustavad platvormid, mis toodavad miljoneid lühikesi DNA järjestusi. Võimaldab järjestada paralleelselt suurt hulka DNA molekule. Esimene turule jõudnud tehnika oli pürosekveneerimine (roche, GS20), mis toimub DNA sünteesi käigus, mille läbi viivaks ensüümiks on DNA polümeraas. DNA
annaabi.ee 
