hnRNP valkudel esinev RNAd-siduv domeen, KH esineb hnRNP K valkudel, domeeni struktuur sarnane RRMle, aga KH on väiksem, RGG box on teine hnRNP valkudel sagedasti esinev RNAga seostumise motiiv, sisaldab Arg-Gly-Gly kordusi, SR on domeen, mis sisaldab dipeptiidseid seriin-arginiin kordusi, SR valgud osalevad eksoni äratundmises pikkade pre- mRNAde puhul etc), pre-mRNAde kompleks hnRNP valkudega takistab lühikeste sekundaarstruktuursete alade moodustumist, mis teeksid pre-mRNA teistele RNAdele või valkudele äratundmismärklauaks. GT-AG reegel peaaegu kõik eukarüootsed intronid algavad GT nukleotiidjärjestusega ja lõppevad AGga. Splaisosoom on ribonukleovalkkompleks, mis koosneb snRNPdest ja pre-mRNAst, teostab splaisingut. Splaisingu mehanism splaisosoom katalüüsib kahe transeserifikatsiooni toimumist, mille tulemusena eksonid splaisitakse ja intron lõigatakse lariaatstruktuurina välja. Eksoni
hnRNP-d kasutatakse tähistamaks pre-mRNA ja teiste, erineva suurusega tuuma RNAde komplekse. hnRNP valgud on väga heterogeensed suurusega 34 kuni 120 kD. Nagu TFid, on ka enamus hnRNP valke modulaarse struktuuriga. Neil on üks või enam RNAgaseostumise domeeni ning üks valkudega interakteerumise domeen. Tänaseks on teada palju erinevaid RNAga-seostumise motiive. pre-mRNAde kompleks hnRNP valkudega takistab lühikeste sekundaarstruktuursete alade moodustumist, mis teeksid pre- RNA teistele RNAdele või valkudele äratundmismärklauaks. Erinevad hnRNP valgud (A1, C, D) tunnevad ära erinevaid järjestusi, näit. hnRNP valgud A1, C, ja D tunnevad ära RNA pürimidiinirikkaid alasid. Lõplikult protsessitud mRNA-5' ots ning hnRNP valk-kompleks (mRNP) assotseerub "cap"-siduva kompleksiga (CBC), mis läbib esmalt NPC. Kui mRNPsid transporditakse läbi NPC, siis tuumas lokaliseeruvad