depoovalgud eksporditavad valgud Valgu struktuur ja koostis Üks või mitu peptiiti Tuhanded aminohapped Titin 3-3,7 megadaltonit Aminohappejäägid Liikuv Valkude struktuuritasemed Primaarne struktuur- aminohappeline järjestus Sekundaarne struktuur- aminohappejääkide stabiilne kolmemõõtmeline struktuur Tertsiaarne struktuur- kogu valgu kolmemõõtmeline struktuur Kvaternaarne struktuur- kahe või enama subühiku ehk alaühiku asend ruumis Saperonid Tugivalgud Valgu funktsioonid Kolmedimensioonilise struktuur Ühedimensiooniline järjestus Ligand Ensüümid Kõrgmolekulaarsed bioloogilised katalüsaatorid Interaktsioonid Valgusüntees Mitmeasteline protsess Ribosoomid Valkude eraldamise meetodid Väljasoolamine erinevad valgud sadestuvad erineva soolakontsentratsiooni juures Dialüüs eraldamine läbi poolläbilaskva membraani
Valkude kokkupakkumine on kooperatiivne protsess 1. Lokaalsete sekundaarstruktuuride formeerumine 5 ms 2. Tertsiaarstruktuuri moodustumine algab, subdomeenide teke , hüdrofoobne kollaps 1s 3. Domeenide lõplik moodustumine, H sidemed 5s 4. Multidomeense struktuuri moodustumine Kokkupakkumine võib olla pidurdatud metastabiilsete vaheühendite tekke kaudu. Kokkupakkumist assisteerivad ensüümid: 1. Peptidüülprolüül isomeraas 2. Disulfiidi isomeraas 3. Saperonid (E.coli GroELGroES) Hemoglobiin ja müoglobiin Hemoglobiin hapniku transportimine veres. Punaste vereliblede valk Müoglobiin lihasrakkude valk Mõlemad valgud sisaldavad prosteetilise rühmana heemi Müoglobiin monomeerne valk, 1 heem Hemoglobiin tetrameerne valk, 4 heemi Kopsudes, kus hapniku partsiaalrõhk on kõrge, seondub hemoglobiin hapnikuga: Hb + 4O2 Hb(O2)4 Lihasrakkudes, kus hapniku partsiaalrõhk on madal, vabaneb hapnik
Tuntuim E. coli E-RseA sigma-antisigmafaktori süsteem, mis tunnetab madala ja kõrge temperatuuri sokki, etanooli, lipopolüsahhariidide defekte ning biofilmi moodustumise represseeritust. Teisisõnu tunnetab E-RseA süsteem ekstratsütoplasmaatilist stressi, mis päädib antisigmafaktori lagundamisega nii periplasmast kui ka tsütoplasmast. Proteolüütilise vabastamise järel sigmaE aktiveerib stressivastusgeenid, millest paljud on periplasmaatilised saperonid, lipiidA biosünteesigeenid jne. Nt Pseudomonas aeruginosas aktiveerib E alginaadi sünteesi. E. coli konserveerunud DNA järjestused, mida tunnevad ära erinevad sigma faktorid. 71 SigmaD (-35 element, vaheala, -10 element) TTGACA N17(1) TATAAT N5-7 G/A SigmaD-l on väga spetsiifilised järjestused, kusjuures kahe elemendi vahelise ala pikkusega reguleeritakse geeni transkriptsiooni kasvufaasist sõltuvalt