tRNA sekundaarstruktuur. Ristikheinaleht. Ulatusliku H-sidemete võrgustiku tekke tõttu tRNA palindroomsetes lõikudes moodustub 4 kaksikhelikaalset domeeni, millest 3 lõpevad silmusega ning neljas ,,tüvega", kus 3' ja 5'-otsad. tRNA-s leidub palju ebaharilikke ribonukleosiide. Erinevate tRNA molekulide minimaalne arv rakus on 31. Ribosoomne RNA. Kõik ribosoomid koosnevad suurest ja väikesest subühikust. Umbes 2/3 osas RNA-st, 1/3 osas valgust. rRNA toimib toena ribosoomsetele valkudele ja võib omada katalüütilist aktiivsust. Kõrge ahelasisene järjestuste komplementaarsus põhjendab (ilmselt) ulatuslikku aluspaaride teket ja kaheahelaliste lõikud moodustumist. Ribosoom koosneb kahest subühikust. Koostis ja suurus on pro- ja eukarüootides veidi erinev: Prokarüootne on väiksem ja sisaldab vähem valke ja nukleotiide. DNA ja RNA erinevused
DNA ja RNA ahela erinevused. tRNA ja rRNA tertsiaarne struktuur. Ribosoomid mõiste, koostis, roll rakkudes. RNA kõrgemad struktuurid: Matriits RNA (mRNA) primaarstruktuur; prokarüootides sisaldab üks mRNA informatsiooni paljude valkude sünteesiks. Ribosoomi RNA (rRNA) eristatakse primaar-, sekundaar-, tertsiaar- ja kvaternaarstruktuure. Kõik ribosoomid koosnevad suurtest ja väikestest subühikutest. Toimib toesena ribosoomsetele valkudele. Transpordi RNA (tRNA) eristatakse primaar-, sekundaar- ja tertsiaarstruktuure. Sekundaarne struktuur moodustub 4 kaksikhelikaalset domeeni, kolm lõppevad ''juuksenõela'' silmusega ja neljas ''tüvega''. Tertsiaarve L-kujuline struktuur moodustub H-sidemete abil. Iga aminohappe jaoks on vähemalt üks unikaalne tRNA, mis kannab selle aminohappe ribosoomile XII METABOLISMI ÜLDPÕHIMÕTTED (Õpik lk 205-237) 1. Seedimise etapid
NB! 1DNA molekul + valgud = kromosoom Kromatiin = nukleoproteiinkompleks, koosneb DNAst, histoonidest ja mittehistoonsetest valkudest. DNA keritakse ümber histoonvalgu poolide Histoonid on oligomeersed aluselised valgud; seostuvad tugevalt DNAga Tekib nukleosoom ehk "helmekee". See on kromo-soomi formeerumise esimene etapp. Nukleosoomid pakitakse helikaalseteks kiududeks solenoidideks. Ribosoomide koostises on ~65% rRNAd ja ~35% valke rRNA toimib toena ribosoomsetele valkudele Sisaldab palju kaheahelalisi spiraliseerunud lõike (hairpin-struktuurid). Tänu kõrgele ahelasiseste järjestuste komplementaarsusele saavad tekkida aluspaarid. rRNA võib olla katalüütiliselt aktiivne. METABOLISM = KATABOLISMI JA ANABOLISMI INTEGRATSIOON Katabolism: · Degradatiivne (lagundav) · Energiat tootev (ATP, NADH, FADH2) · Rajad on konvergentsed, st koonduvad vähesteks lõppproduktideks
kvarternaarstruktuure c) bioloogiline roll tRNA ülesandeks aminohapete transport valgu sünteesis. Iga aminohappe jaoks vähemali üks unikaalne tRNA. mRNA vahendab geneetilist koodi. DNA transkriptsiooni käigus sünteesitakse heterogeenne tuuma RNA, kus vahelduvad intronid ja eksonid. Splaissimise käigus lõigatakse intronid välja ja saadakse küps mRNA. rRNA ribosoomide struktuuri ja funktsiooni alus, toimib toena ribosoomsetele valkudele snRNA on oluline eukarüootsete geenide esmaste transkriptide protsessingul küpseks mRNA'ks enne eksporti tuumast tsütoplasmasse. siRNA osaleb transkriptsioonijärgses geenide vaigistamises d) lokalisatsioon rakus RNA'd sünteesitakse tuumas, seejärel transporditakse aga tsütoplasmasse 13. Joonistage mingi riboosi sisaldava dinukleotiidi põhimõtteline struktuur.