NMD toimub tsütoplasmas. nonsense mediated decay ühe või enam eksoni vahele jätmine, mis põhjustab ekson- intron liidese vahetus 3' läheduses Stop koodoni sissetuleku. Kõigi korrektselt splaisitud mRNAde puhul Stop koodon on viimases eksonis. Nonsense mediated decay vahendab kiiret mRNAde lagundamist, kus Stop koodonid esinevad mRNAs enne viimast splaisiliidest. Arvatakse,et Stop koodoni sissesplaisimise korral ekson-intron liidese kompleksid RNA- lt lahti ei tule ning seda ribosoomset skanneerimist ei alustata. Capping protsess 5' cap on spetsiaalne mRNA 5' lõpu otsa pandud nukleotiidne lõpp. Protsess on oluline, et luua küpset mRNA, mis saab astuda translatsiooni. Cappimine kindlustab mRNA stabiilsuse translatsiooni ajal (valgusünteesi protsessi ajal). See on väga reguleeritud protsess, mis toimub rakutuumas ja vaid funktsionaalne mRNA transporditakse tsütoplasmasse. Cap on guanosiinnukleotiid, mis on seotud mRNA külge 5' 5' !!! trifosfaat sidemega.
Kõigi korrektselt splaisitud mRNade puhul Stop koodon on viimases eksonis. Nonsense mediated decay vahendab kiiret mRNAde lgundamist, kus Stop koodonid esinevad mRNAs enne viimast splaisiliidest. Arvatakse, et osad ekson-intron liidese kompleksi valgud osalevad nonsense mediated decay's. Ekson-intron liidese kompleksid interakteeruvad vahetult deadenülaasi kompleksiga. Arvatakse, et Stop koodoni "sisse splaisimise" korral ekson-intron liidese kompleksid RNAlt lahti ei tule ning seega ribosoomset skaneerimist ei alustata. Nonsense mediated decay toimub tsütoplasmas. Hulgaliselt on tõendeid selle kohta, et pioneeriv ribosoom transleerib mRNAd, kui tema 5' otsaga on assotseerunud cap-siduv kompleks ning polü(A) saba on assotseerunud tuumse PABPIIga. See on tekitanud oletusi, et esimene translatsiooni tsükkel toimub tuumas kui nonsense-mediated decay järelvalve mehanismi üks komponente.
annaabi.ee 
