c) DNA oligonukleotiid/mRNA kompleksi degradatsioon Dicer ensüümi poolt d) RNaasH vahendatud mRNA degradatsioon oligonukleotiid/mRNA dupleksist 4. Milline järgnevatest nukleiinhappe ahelate dupleksitest on hübridisatsioonil kõige stabiilsem? a) DNA:RNA b) DNA:DNA c) RNA:RNA 5. Mis on ribosüüm? a) Spetsiifilise sihtmärkjärjestusega seonduv RNA molekul, mis katalüüsib ensümaatilisi reaktsioone b) RNA molekul, mis katalüüsib ribonukleaaside degradatsiooni c) Mitte ükski sellest valikust d) Ribosoome lõikav ensüüm 6. Millised järgnevatest meetoditest sobivad nukleiinhapete detekteerimiseks a) Absorptsiooni mõõtmine =260 nm juures b) Biotiini või digoksigeniiniga märgitud DNA kemoluminestsents c) Kõik meetodid sobivad d) Radioaktiivselt märgitud nukleiinhapete autoradiograafia e) Flourestsentsmärgisega märgitud nukleiinhappe ergastamisel saadud valguse emissiooni mõõtmine
hulgal. o CP sgRNA sünteesitakse hiljem ja ta on väga mažoorne. IRES- elemendid (võivad erinevatel tobamoviirustel asuda MP ja /või CP geeni ees) ning võimaldavad vastavate valkude transaltsiooni otse genoomselt RNA-lt. Genoomi 3’ ots moodustab tRNA like struktuuri. Viiruse seisukohalt on tRNA-like struktuur negatiivse RNA ahela sünteesil promootoriks ja arvatavasti ka kaitseks raku ribonukleaaside vastu. TMV genoomi kodeerivad alad ORF1- 126 kDa valk, TMV replikaasi subühik, seondub infitseeritud rakkudes membraaniga. Osaleb viiruse genoomse ja sgRNA-de cap-imisel ja sisaldab RNA- helikaasset domeeni. ORF2- 183 kDa valk, TMV replikaasi katalüütiline subühik. Translatsioon toimub UAG terminaatorkoodoni mahasurumise teel (“read-through” strateegia). Mahasurumise efektiivsus on ca 5-10%. MP, movement protein, sünteesitakse sgRNA-lt: hüdrofoobne, seondub
Rabiese viirus (rabdoviirused) Struktuur. Lihtsad viirused, kodeerivad ainult viit valku. Kuulikujulised, ümbrisega. Diameeter 50…95 nm, pikkus 130…380 nm. Pinnal on trimeersest glükoproteiinist (G) ogad, millega viirus kinnitub. Antikehad ka G vastu. Nukleokapsiid on helikaalne, RNA on üheahelaline (-) umbes 12000 aluspaarist. Nukleokapsiidis veel nukleoproteiin N, suur (L) ja mittestruktuused (NS) valgud. Maatriksivalk (M) ümbrise ja nukleokapsiidi vahel. N kaitseb RNAd ribonukleaaside eest ja hoiab transkriptsiooniks sobilikku konfiguratsiooni. L ja NS teevad RNA-sõltuva RNA-polümeraasi. Epidemioloogia. Viirus-indutseeritud agressiivne käitumine loomadel promob viiruse levikut. Inkubatsiooniperiood on pikk, asümptomaatiline. Ülekanne: zoonoos (metsloomad, vaktsineerimata koerad-kassid on vektorid). Viiruse allikas on peamiselt marutõbise looma hammustus, aga minoorselt ka marutõbiste nahkhiirte koobaste aerosoolid. Viirus on ülemaailmne, v.a. mõned saarerahvad
splaissitakse) ning transporditakse seejärel tsütoplasmasse, kus toimub translatsioon (vt. ka eestpoolt, kus on võrreldud eukarüootset ja prokarüootset transkriptsiooni). Rakutuumas sisalduv RNA on nii koostiselt kui ka pikkuselt väga heterogeenne (heterogeneous nuclear RNA hnRNA). Suur osa sellest on mittekodeeriv, sisaldades pre-mRNA-st splaissingu tulemusena väljalõigatavaid intronjärjestusi, mis seejärel kiiresti degradeeritakse. Selleks, et kaitsta RNA-d ribonukleaaside (valgud, mis lagundavad RNA-d) eest, kaetakse RNA molekulid RNA-ga seonduvate valkude poolt. Selle tulemusena on eukarüootse RNA eluiga võrreldes prokarüootsega oluliselt pikem poolestusajaga viis tundi võrreldes bakteri RNA keskmiselt mõne minuti pikkuse poolestusajaga. RNA polümeraasid eukarüoodi rakus Võrreldes bakteriraku RNA polümeraasiga on eukarüootsed RNA polümeraasid märksa komplekssemad, koosnedes enam kui kümnest subühikust
splaissitakse) ning transporditakse seejärel tsütoplasmasse, kus toimub translatsioon (vt. ka eestpoolt, kus on võrreldud eukarüootset ja prokarüootset transkriptsiooni). Rakutuumas sisalduv RNA on nii koostiselt kui ka pikkuselt väga heterogeenne (heterogeneous nuclear RNA hnRNA). Suur osa sellest on mittekodeeriv, sisaldades pre-mRNA-st splaissingu tulemusena väljalõigatavaid intronjärjestusi, mis seejärel kiiresti degradeeritakse. Selleks, et kaitsta RNA-d ribonukleaaside (valgud, mis lagundavad RNA-d) eest, kaetakse RNA molekulid RNA-ga seonduvate valkude poolt. Selle tulemusena on eukarüootse RNA eluiga võrreldes prokarüootsega oluliselt pikem poolestusajaga viis tundi võrreldes bakteri RNA keskmiselt mõne minuti pikkuse poolestusajaga. RNA polümeraasid eukarüoodi rakus Võrreldes bakteriraku RNA polümeraasiga on eukarüootsed RNA polümeraasid märksa komplekssemad, koosnedes enam kui kümnest subühikust