avaldumine on oluline rakkude kiire kasvu korral. Geenid, mille transkriptsioon toimub harva või neid transkribeeritakse kehvades kasvutingimustes, on kromosoomis juhuslikult orienteeritud. 28. Milliste mehhanismide abil jätkub DNA replikatsioon siis, kui DNA replikatsiooni elongatsioonikompleksi töö on pärsitud DNA kahjustuse tõttu? Iga replikatsiooni initsiatsiooni korral oriC-lt on aeroobsetes tingimustes kasvavate rakkude puhul 10-45%-line tõenäosus, et üks või mõlemad replikatsioonikahvlitest peatuvad DNA kahjustuste tõttu, mida pole jõutud parandada ning vajavad replikatsiooni jätkumiseks rekombinatsioonilist DNA reparatsiooni. DNA replikatsioonikahvel peatub, kui DNA ahelas on kas DNA kahjustus, üksikahelaline või kaksikahelaline katke. Toimub rekombinatsiooniline reparatsioon RecF, RecO ja RecR osalusel. RecA soodustab DNA ahelate ülekannet, aitab neil paarduda ning osaleb DNA ahelate hargnemiskoha migratsioonil.
Igas E. coli rakus tekib generatsiooni kohta 3000 - 5000 DNA kahjustust, enamus neist on oksüdatiivsed DNA kahjustused. RecA-defektsed rakud on kõrgema suremusega (kuni 50% rakke sureb) ning see on enamasti tingitud replikatsioonikahvli peatumisest. RecBCD-defektsetes rakkudes akumuleeruvad kaksikahelalised DNA katked. Iga replikatsiooni initsiatsiooni korral oriC-lt on aeroobsetes tingimustes kasvavate rakkude puhul 10-45%-line tõenäosus, et üks või mõlemad replikatsioonikahvlitest peatuvad DNA kahjustuste tõttu, mida pole jõutud parandada ning vajavad replikatsiooni jätkumiseks rekombinatsioonilist DNA reparatsiooni. Olukorras, kus replikatsioonikahvel peatub sageli DNA kahjustuste tõttu, näiteks SOS vastuse korral, kus bakterirakus on tekkinud hulgaliselt DNA katkeid, algatatakse oriC-sõltumatu alternatiivne DNA replikatsioon. Mikroobipopulatsiooni evolutsioneerumine statsionaarses faasis