ja/või keskkonna signaalid mõjutavad c-di-GMP kas üldist või lokaalset taset rakus. 3. Mikrokoloonia moodustumine pinnale kinnitunud ning eksopolüsahhariide tootva raku klonaalse paljunemise tulemusena tekib mikrokoloonia. 4. Küps biofilm mikrokoloonia areneb biofilmiks, mille polümeerses limamaatriksis paiknevad nii rakud kui ka avatud veekanalid struktureeritult. Mikrokolooniast biofilmi moodustumisel on oluline osa bakterirakkude hulga tunnetamisel (quorum sensing). Näiteks ramnolipiidide ajaliselt reguleeritud ekspressioon P. aeruginosas. Suuremas kui 20 µm-s P. aeruginosa mikrokoloonias lülitatakse hulga tunnetuse vahendusel sisse ramnolipiidide süntees, mis soodustab nii mikrokoloonia arengut, seenekujuliste struktuuride teket biofilmis, veekanalite püsimist avatuna biofilmi maatriksi küpsemise käigus, kui ka P. aeruginosa irdumist biofilmist. 5. Biofilmist irdumine Arvatakse, et tegemist on reguleeritud levimisstrateegiaga, mis võimaldab uute
RsmA seondumisjärjestus Shine-Dalgarno järjestusest eemal, tihti on seotud aktiveeriv toime mRNA sekundaarstruktuuri avamisega, mille tulemusel Shine- Dalgarno järjestus muutub ribosoomile kättesaadavaks. Tavaliselt RsmA pärsib hulgatunnetuse signaalmolekulide sünteesi, millest tulenevalt inhibeeritakse ka patogeneesiks vajalike faktorite süntees, nagu püotsüaniid (phz), vesiniktsüaniid (hcnABC), elastaas (lasB), ja lektiin (lecA). RsmA reguleerib positiivselt lipaasi (lipAH) ja ramnolipiidide (rhlAB) sünteesi ja seeläbi liikumist. GacS-GacA süsteem on seotud P. aeruginosa antibiootikumitundlikkusega. Kuigi täpne mehhanism on teadmata, on nähtud, et P. aeruginosa gacS tüved on tundlikumad gentamütsiinile ning klooramfenikoolile. Samas tetratsükliini juuresolekul (kontsentratsioonil, mis on kasvu pärssivast doosist madalam), on gacS transkriptsioon alla reguleeritud ning RsmA kontsentratsioon rakus kuni 3 korda kõrgem