Kui on ribosoomi valgud, siis ei lõika. Lõikab sealt, kust ribosoomi valke pole seondunud. Rnaas P – spetsiifiliselt lõikab tRNA 5’otsa. Koosneb kahest subühikust: RNA ja valk. Lõikamise määrab katalüütiliselt aktiivne RNA. Valk kiirendab produkti vabanemist. Rnaas E – suur molekul. Seotud degradosoom. Osaleb 5’ S rRNA protsessimises. Degradosoom lagundab RNA-d. Ribosoomi RNA-st on 1% modifitseeritud nukleotiide. Modifikatsioonid lisatakse pärast transkriptsiooni. On nn pseudouridiini modifikatsioon. Siin töötab S-ensüüm. U nukleotiide keeratakse ringi. Iga modifikatsioon tehakse eraldi. Kolm pseudouridiini on 54 tähtsad bakterite elus, teised pole. Pseudouridiini ensüüm on ka samaaegselt ribosoomi chaperoniks. Ta pakib ribosoomi õigesti kokku. Ilma selleta on ribosoomi efektiivsus tohutult väiksem. 30S rRNA sünteesil tekivad juuksenõelastruktuurid väga täpselt ja kontrollitult. Lõpp-struktuur tekib nende vahevormide kaudu
4. tRNA struktuur, funktsionaalsed osad mRNA kood transleeritakse valguks läbi adaptermolekulide-tRNA · Sekundaarstruktuur ristikheinalehe kujuline: · Pikkus 72-94 nukleotiidi, loetakse 5' otsast · Antikoodon- 34-36 · Kolm lingu + paardumata 3'osa · 3' järjestus CCA 74-76, lisalingu nukleotiidid 47, 47:1 jne. · tRNA 3' paardumata osale järgneb aktseptoorne õlg, 7 aluspaari · Pseudouridiini õlg (T õlg) · Antikoodon õlg- 5 aluspaari, lingus alati 7 nukleotiidi · D-õlg, 4 aluspaari, dihüdrouridiin, lingu pikkus varieeruv tRNA kolmemõõtmeline struktuur on L kujuline, moodustub heeliksite liitumise teel- coaxial stacking Struktuurid sarnased, kuna liituvad ribosoomi samasse saiti- erinevused antikoodoni ja aktseptorõla osas (ka teised nukleotiidid võivad olla erinevad) 5