Streptococcus mutans kaariese tekitaja. Nad kinnituvad kapsliga hambaemailile, toodavad käritamisel piimhapet ja see koguneb nende kapslitesse, söövitades hambaemaili augud. Kapsli sünteesil kasutatakse juuretisena sahharoosi. Magu toidust ja suuõõnest. Maomahl hävitab enamuse. Tänu happelisele kk-le ei ole maos soodsaid tingimusi ka normaalse mikrofloora kujunemiseks. Alahappelises maos võivad elada ka bakterid, keda kahtlustatakse maohaavade ja maovähi tekkes. Kõige rohkem proteobaktereid. Soolestik kaksteistsõrmikus on suht vähe mikroobe. Kui rohkem mikroobe, siis viitab mao alahappesusele. Peensoole alumises osas ja jämesooles palju mikroobe. Soolestikus on rohkem baktereid kui Maal inimesi. Enamus jämesoole mikroobe on anaeroobid. Fakult.anaeroobid. nad toituvad ainetest, mis ülemistes seelekulgla osades seedimata ja imendumata jäävad (kiudained) ning ka irdunud sooleepiteelist ja soolelimast
leitud maisist, kohvipuu marjadest ning arktilises tundras kasvavates lugades (Juncus trifidus). Kuigi taimedest on leitud valdavalt neljast hõimkonnast baktereid, kuuluvad bakterid väga paljudesse perekondadesse ning taim-bakter suhe, kas tegu on mutualismi või patogeensusega, sõltub rohkem taime ja bakteri genotüübist, kui sellest, millise bakterina on ta varem kirjeldatud. Proteobacteria hõimkonnast on enim leitud taimedest -proteobaktereid (26%), millest omakorda on enim kirjeldatud liike perekondadest Pseudomonas, Enterobacter, Pantoea, Stenotrophamonas ja Acinetobacter. Perekonna Pseudomonas tuntud liikidest on kirjeldatud nii taime kasvu soodustavaid liike, P. fluorescens, P. putida kui ka taimpatogeene nagu P. aeruginosa, P. syringae, kui ka inimpatogeene P. aeruginosa. Sarnaselt perekonnale Pseudomonas võib leida ka teistest bakteriperekondadest nii mutualistlikke baktereid, kommensante kui ka patogeenseid liike.