T7 ja T3 praimerite sulamistemperatuurid on : ( 8*4+12*2)=56 oC. Kui "annealing" või hübridisatsiooni temperatuur peab praimeri sulamistemperatuurist olema ~5 oC madalam, siis sobiv temperatuur antud PCR reaktsiooniks on 56-5=51 oC. 4.2) Millise osa PCR produktist moodustab plasmiidi järjestus? Tee see kindlaks kasutades pBS KS+ plasmiidi kaarti (eelnevalt antud), nn. "multiple cloning site" järjestust kasutades. T7 promootorist SAC2 ni ja SAC2-st T3 promootorini. 4.3) Arvuta Wallace reegli abil praimerite X: 5'-AAGATGCCATGAAGATGCCA-3' ja Y: 5'- TGGCATCTTCATGGCATCTT-3' sulamistemperatuurid. Milline näeb välja PCR profiil, kui nende praimeritega amplifitseerida 250 bp pikkust fragmeti. Arvesse tuleb võtta, et Taq polümeraasi kiirus on ligikaudu 1000 nt/min. Praimerite X ja Y sulamistemperatuurid on : (9*4+2*11) =58 oC. 4.4) Kui 100 l PCR mastermix kohta panna 8 l 25 mM MgCl2, 10 l 2 mM dNTP ja 5 l mõlemat
N-terminaalses otsas asuvast aminohappest ja selle modifitseerumisest sõltub, kas geen ekspresseerub või mitte. 48. Nimeta histoonide kovalentseid modifikatsioone. Milline neist põhjustab DNA ja histoonide vaheliste elektrostaatiliste jõudude nõrgenemise? Atsetüleerimine, metüleerimine, fosforüleerimine, ubikvitineerimine. Atsetüleerimine põhjustab histoonide ja DNA vahelise elektrostaatilise jõu nõrgenemise, mis laseb RNA polümeraasil kergemini DNA molekuli vahel liikuda promootorini. 49. Miks on imetajate emasorganismis vajalik ühe X-kromosoomi heterokromatiiniks kondenseerimine? Et vältida olukorda, kus emasorganism hakkab geeni korraga kahelt kromosoomilt ekspresseerima, põhjustades geeniproduktide ebavõrdsuse emas-ja isasorganismide vahel. 50. Miks nimetatakse inaktiveerunud X-kromosoomi fakultatiivseks heterokromatiiniks? Mis juhtub tunnustega, mis on määratud X-kromosoomil olevate geenidega?
ekspresseerub või mitte. 48. Nimeta histoonide kovalentseid modifikatsioone. Milline neist põhjustab DNA ja histoonide vaheliste elektrostaatiliste jõudude nõrgenemise? Atsetüleerimine, metüleerimine, fosforüleerimine, ubikvitineerimine. Atsetüleerimine põhjustab histoonide ja DNA vahelise elektrostaatilise jõu nõrgenemise, mis laseb RNA polümeraasil kergemini DNA molekuli vahel liikuda promootorini. 36 49. Miks on imetajate emasorganismis vajalik ühe X-kromosoomi heterokromatiiniks kondenseerimine? Et vältida olukorda, kus emasorganism hakkab geeni korraga kahelt kromosoomilt ekspresseerima, põhjustades geeniproduktide ebavõrdsuse emas- ja isasorganismide vahel. 50. Miks nimetatakse inaktiveerunud X-kromosoomi fakultatiivseks heterokromatiiniks
annaabi.ee 
