välismembraani. G(-) bakterites läbib DNA välismembraani kasutades PilQ sekretiini kanalit. G(-) bakterid kasutavad DNA välismembraanist ja peptiidoglükaankihist läbiviimiseks tüüp 2 sekretsioonisüsteemi või tüüp 4 piilisid. Siiski piilide täpne roll transformatsioonis on jäänud ebaselgeks. G(+) bakteritel on pseudopiilid, mis täidavad G(-) bakterite piilidega sama rolli. G(+) pseudopiilisid kodeerivad comG operoni geenid ning ComGC on peamine piliin. Transformatsioonipiili on hädavajalik dsDNA kinnitumiseks ja transformatsiooniks. Arvatakse, et nii G(+) kui ka G(-) bakterid kasutavad transformatsioonipiilisid selleks, et tuua ekstratsellulaarne dsDNA retseptorini ComEA. DNA sisenemine rakku. Tõenäoliselt esitleb ComEA dsDNA nukleaasile, mis lagundab dsDNA üheahelaliseks, sisestamaks DNA-d rakku. S. pneumonia'l on nukleaasiks EndA, mis lagundab DNA üheahelaliseks ning suunab ComEC
geenide ekspressioonitaset operonisiseselt. Näiteks laktoosioperoni puhul toimub lacY-spetsiifilise mRNA degradatsioon ligikaudu 2-korda kiiremini kui lacZ mRNA lagundamine. Geenide ekspressioonitaset kontrollitakse operonisiseselt mRNA stabiilsuse kaudu F plasmiidi tra operonis. See operon on 32 kb-pikkune ja sisaldab hulgaliselt geene, mille produktide järele on rakus erinev vajadus. Kõige enam vajatakse traA geeni produkti piliin, mis on piilide koostisosa. Piliini kodeerivad mRNA segmendid on teistest tunduvalt stabiilsemad. Kuigi nad on 5' otstest heterogeensed, on kõigi segmentide 3' otsad identsed mRNA-d stabiliseeriva juuksenõelastruktuuri tõttu. 17 5. Translatsiooni regulatsioon Translatsiooni regulatsioon võib toimuda kas initsiatsiooni, elongatsiooni või terminatsiooni kaudu.