totaalvalgu lahutamist 2-D polüakrüülamiid-geelelektroforeesil. Igale valgule vastab geelis kindel koht, kus valk on visualiseeritav täpina. Mida rohkem on valku, seda intensiivsem on vastav täpp. Kui eraldada totaalvalk erinevates tingimustes kasvatatud bakterirakkudest, näeme täppide mustris erinevusi. Mass-spektromeetria võimaldab määrata valgu järjestusi ka väga väikeste valgukoguste (pikomoolide ja isegi femtomoolide) korral, mida on võimalik saada valkude puhastamisel 2-D geelist. Geelist isoleeritud valkude aminohappelist järjestust võrreldakse bakteri geenijärjestustelt tuletatud aminohappelise järjestusega ja saadakse teada, milliste geenide poolt on uuritavad valgud kodeeritud. See meetod annab jällegi üldist informatsiooni erinevatel tingimustel üles või alla reguleeritavatest geenidest. Paljudel juhtudel ei
Erinevate valkude hulga hindamiseks bakterirakus kasutatakse totaalvalgu lahutamist 2-D polüakrüülamiid-geelelektroforeesil. Igale valgule vastab geelis kindel koht, kus valk on visualiseeritav täpina. Mida rohkem on valku, seda intensiivsem on vastav täpp. Kui eraldada totaalvalk erinevates tingimustes kasvatatud bakterirakkudest, näeme täppide mustris erinevusi. Mass-spektromeetria võimaldab määrata valgu järjestusi ka väga väikeste valgukoguste (pikomoolide ja isegi femtomoolide) korral, mida on võimalik saada valkude puhastamisel 2-D geelist. Geelist isoleeritud valkude aminohappelist järjestust võrreldakse bakteri geenijärjestustelt tuletatud aminohappelise järjestusega ja saadakse teada, milliste geenide poolt on uuritavad valgud kodeeritud. See meetod annab jällegi üldist informatsiooni erinevatel tingimustel üles või alla reguleeritavatest geenidest, kuid seda valgu hulga tasemel