- Praimerid – lühikesed DNA lõigud, mis piiritlevad paljundatava piirkonna kogu DNA-st märgistavad sünteesi alguskoha Erinevaid praimereid saab sünteesida vastavalt soovitavale DNA lõigule. Geel – elektroforees: - DNA proov kantakse geeli “hambasse” koos lahust raskemaks tegeva värvainega - Elektroforeesil liiguvad eri pikkusega DNA järjestused erineva kiirusega, lühemad kiiremini - Võrdluseks liiguvad geelil ka standardsed pikkusmarkerid, mille pikkus, nukleotiidide hulk on teada - Kasutatakse ainult DNA-ahelale seonduvat fluorestseeruvat värvi, mis võimaldab neid elektroforeesijärgselt detekteerida - Eri pikkusega DNA lõikudse kogumikele vastavad kriipsukesed geelil või sellest tehtud pildid Kordamisküsimused 1. Põhikursuses õpitud molekulaargeneetika kordavalt – replikatsioon, transkriptsioon, translatsioon
-Erinevad flourestsentsmärgised võimaldavad teha vahet sama pikkusega STR alleelide vahel -Praimerite valik/disain ülioluline -10 või enam STR lookust amplifitseeritakse samaaegselt -STR kitid müügil Väljakutsed -Praimerite disainimine (pole programme) 17 -reaktisooni optimiseerimine katse-eksituse meetodil, võtab aega Multipleks PCRi eelised -Ajaühikus saadakse rohkem infot -Väiksem töökulu tulemuste saamiseks -Vaja vähem proovi 10.Pikkusmarkerid ja alleelsed redelid STR alleelide kindlaktegemisel (mida endast kujutavad, miks on vaja). DNA polümorfismide tüübid: -Järjestuse polümorfism Ühe nukleotiidi polümorfism (SNP - single nucleotide polymorphism) Insertsioonid/deletsioonid AGACTAG(A/G)CATTAGA -Pikkuse polümorfism Korduvad järjestused AGTTC(GATA)(GATA)(GATA)TCCAG 18 Kordamisküsimused (Andres Veske) 1.Numbriliste ja struktuursete kromosoomi anomaaliate klassifikatsioon
erinevad fluorestsentsmärgised võimaldavad vahet teha sama pikkusega STR alleelide vahel Praimerid: ei tohi kinnituda samasse kohta ega omavahel valik/disain ülioluline Eelised: ajaühikus saadakse rohkem infot väiksem töökulu tulemuste saamiseks vaja vähem proovi Väljakutsed: praimerite disainimine (pole programme) reaktsiooni optimeerimine katseeksituse meetodil, võtab aega 10. Pikkusmarkerid ja alleelsed redelid STR alleelide kindlaktegemisel (mida endast kujutavad, miks on vaja). Alleelne redel on komplekt erinevaid alleele, mis on kokku pannud enamlevinud alleelivariantidest. Kapillaarides jooksutatakse paralleelselt kaks proovi: ühes kapillaaris pikkusmarker + uuritav DNA, teises pikkusmarker + alleelne redel. Pikkusmarkeris on alati teadaoleva
annaabi.ee 
