ühine eellane Most recent common ancestor 58. OTU organismid fülogeneesi rekonstruktsioonis, mille kohta on andmeid, k.a. fossiilseid 59. ortoloogsed geenid ühise päritoluga homoloogsed geenid erinevates organismides 60. paraloogsed geenid ühe organismi geenid, eellasliinides toimunud geeniduplikatsiooni tõttu on tekkinud erinevad geenid samas organismis (nt globiinide geeniklaster, kus palju erinevaid paralooge) 61. tunnus (süstemaatikas) (mõiste) ehk homoloogilise sarnasuse 62. rudimentaarsed ehk vestigiaalsed organid (mõiste ja näiteid)mandunud elundid, funktsionaalselt tähtsusetud jäänukorganid volt inimese silmanurgas 63. stromatoliidid on lubiainest moodustis, mis tekib vees tsüanobakterite (ehk sinivetikate) või teiste mikroorganismide elutegevuse toimel. 64. geenikonversioon (mõiste) ebavõrdne ristsiire toimub meioosi käigus rekombinatsioonil, tekivad
EKAATYEQIKAAVKAAAEGEMKGVLGYTEDDVVSTDFNGEVCTSVFDAKAGIALNDNFVKLVSWYDNETGYSN b. Milline on uuritav valk, millised ortoloogid ja paraloogid leiti erinevatel otsingutel? . ortoloog eri liikidest pärit järjestused, millel on üks ühine eellane 4 paraloog samast liigist pärit järjestused, millel on üks ühine eellane Uuritav valk: Glyceraldehyde 3-phosphate E. Colide puhul esineb nii ortolooge kui paralooge. Näiteks paraloogid: >>UNIPROT:Q6WAN9_ECOLX Q6WAN9 Glyceraldehyde phosphate d (220 aa) initn: 1051 init1: 715 opt: 721 Z-score: 859.5 bits: 166.6 E(): 2.7e-39 Smith-Waterman score: 1058; 75.8% identity (75.8% similar) in 244 aa overlap (36-244:1-220) 10 20 30 40 50 60 Sequen VFRAAQKRSDIEIVAINDLLDADYMAYMLKYDSTHGRFDGTVEVKDGHLIVNGKKIRVTA ::::::::::::::::::::::::::::::
bakteritelt selgroogsetele), Segmentaalne duplikatsioon duplikatsioon suurte blokkidena, Polüploidsuse teke terve genoomi ploidia kordistumine. 24. Kromosoomide ja genoomide evolutsioon. Võrreldes H.influenza ja M.genitaliumi on minimaalse genoomi suurus 300 geeni (arvestatud ortoloogsete geenide hulka ja geeniasendusi s.t. samaseid funktsioone kannavad mitteortoloogsed geenid). Minimaalse genoomi mõiste seotud ortoloogsete geenide klastrite mõistega (COG), sisaldavad ka erinevaid paralooge. Genoomide võrdlemine toob esile 327 universaalset COG-d, defineerides ka organismile vajaliku minimaalse geenide hulga. Genoomi suurust peegeldab ka genoomi asendatavus (redundancy), mis on võrdne paraloogia tasemega. Seda omakorda defineeritakse geenide fraktsiooni järgi, millel on genoomis vähemalt üks paraloog. Paraloogia suhteline tase kahe genoomi vahel on võrdne RLP12=ruutjuur N1/N2. N1 ja N2 on geenide arv kahes erinevas genoomis. Paraloogia tase E.coli ja H