Märtsipommitamise ajal hävis Maneezi tänava hoone. Seoses Eesti taasiseseisvusega 1991. aastal ja sellega kaasnenud reformidega kasvas märkimisväärselt Riigiarhiivi poolt väljastatud omandi- ja sotsiaalõiguslike teatiste arv. Arhiivil tuli vastu võtta suurel hulga dokumente tegevuse lõpetanud nõukogudeaegsetest asutustest ja erastatud ettevõtetest , palju väärtuslikku materjali saadi Eesti pagulastelt. 3. STURKTUUR 3.1 Järelvalveosakond Järelevalveosakonna põhiülesandeks on arhiivijärelevalve alla kuuluvate arhiivimoodustajate nõustamine, nende üle järelevalve teostamine, arhivaalide hindamine. Järelevalveosakond annab arvamusi järelevalvealuste asutuste dokumentide loetelude kohta, viib läbi arhivaalide hindamist arhiiviväärtuse väljaselgitamiseks, peab arvestust riigiarhiivi
kasvavat huvi arhiivides talletatava järele, peab tagama informatsiooni pikaajalise säilimise. Sellest tulenevalt loodi veebikeskkond Digisisu, kuhu kavatsetakse koondada enim kasutatavad Rahvusarhiivi allikad. Oma arhiivid on ka paljudel väliseesti organisatsioonidel, mis on moodustunud peamiselt pagulaste arhiividest.27 Alates 1990. aastate algusest on Rahvusarhiivi üle antud hulgaliselt väärtuslikke arhiivifonde Eesti pagulastelt. Eesti-ainelist arhiivimaterjali võib leida paljude maade arhiividest, muuseumidest, teadusasutustest. Rohkesti arhiiviväärtuslikku dokumentatsiooni on ka välismaal elavate eestlaste valduses. Välismaa arhiividest on Estica (Baltica) poolest rikkamad nende maade arhiivid, kelle koosseisu on Eesti pikemat või lühemat aega kuulunud või kes on Eesti lähinaabrid. 26 ,,Oleviku minevikud" (2010) lk 135 27 ,,Oleviku minevikud" (2010) lk 142-145