Ta kirjutas "Traktaadi maalikunstist" ja "Traktaadi arhitektuurist". Leonardo joonistab koljusid, mida peetakse eriti hästi tehtuteks. Leonardo sõbrustas hauakaevajatega ja maksis raha, et nad tooks talle koljusid. Tema anatoomilised joonistused, mis esmakordselt tulevad välja hõbekrihvli alt, olid esimeseks sammuks anatoomiat käsitleva arutluse poole. Geenua õpetlase Marco Antonio della Torre juures õpib ta anatoomiat. Marco lõikab laipe ja Leonardo joonistab lihaseid konte. Montorfano alustab Santa Maria delle Grazie refektooriumi seinale oma pildi maalimist, ent Moro näeb, kui vilets kunstiteos sellest tuleb ja kutsus kohale mehe Vincist. Ta käskis tal maha kraapida Montorfano pilt ja teha sinna midagi muud. Nii maalibki Leonardo sinna "Püha õhtusöömaaja" (1495-98). Pildil on kujutatud 13 meest: Lunastaja, Peetrus, Johannes, Jaakobus, Toomas, Filippus, Bartolomeus, Mattias, Andreas, Matteus, Paulus, Siimon ja Juudas
Kogu väärtusliku metalli oli välja nõudnud Moro naige Beatrice. Leonardo vaatas, kuidas meister Alberghetti sügavalt vees istuval laeval viis minema tema unistuse reipalt tagajalgadele tõusnud ,,Cavallost". Aga kirikukellad Milanos helisesid lakkamatult ja ka need olid pronksist. Inimkonna suurima skulptuuri lõpetamise asemel pidi Leonardo nüüd tapetiseerima Beatrice tubasid. Ta kuivatas soid, ehitas lüüse ja remontis Milano kindlusi. Aga nüüd sai ta jälle uue tellimuse. Montorfano oli alustanud Santa Maria delle Grazie refektooriumi seinale oma pildi maalimist, kuid Moro nüüd näeb, kui vilets kunstiteos sellest tuleb ja kutsus kohale Leonardo. Ta käskis tal maha kraapida Montorfano pildi ja teha sinna midagi muud. Nii maalibki Leonardo sinna "Püha õhtusöömaaja", sest ta teadis, et paljudel teistel, on selle maalimine nurjunud. Räägiti, et kloostri prior oli väga tüütaval kombel Leonardot taga kihutanud, et too