Erinevaid translatsiooni kontrolli mehhanisme on eukarüootides nii palju, et neid üldkursuses puudutada ei jõua. Erinevate mRNA-de translatsiooni kontrollitakse initsiatsioonifaktorite (eIF-de), mRNA struktuuride, mRNA-ga seonduvate valkude, mRNA polü-adenüleerimise, mRNA rakulise lokalisatsiooni jm kaudu. Prokarüootides toimub enamasti sisemine initsiatsioon st. mRNA sisaldab mitut tsistronit ja valgusüntees toimub kõigil initsaatorkoodoni ja Shine-Dalgarno järjestusega varustatud lugemisraamidel. Eukarüootidel on valdav (>95% mRNA-dest) initsiatsioon mRNA 5' otsale kõige lähemal asuvalt initsiaator-koodonilt. AUG koodonite või tugevate (> -50 kJ/Mol) RNA sekundaarstruktuuride tekitamine 5´cap-i ja valku kodeeriva lugemisraami vahele inhibeerib sellelt translatsiooni või kaotab selle sootuks. Siit tuleneb klassikaline skaneeriv translatsiooni intsatsiooni mudel, mille kohaselt ribosoom seostub mRNA-le 5´cap-st sõltuvalt ning koos initsiaator-tRNA'ga skaneerib
Bakteril on 3 initsiatsioonifaktorit, eukarüoodil on 12 erinevat valku või mitmest valgust koosnevat kompleksi. Erinevate mRNA-de translatsiooni kontrollitakse: initsiatsioonifaktorite (eIF), mRNA struktuuride, mRNA-ga seonduvate valkude, mRNA polü-adenüleerimise, mRNA valgulise lokalisatsiooni kaudu Prokarüootides toimub enamasti sisemine initsiatsioon – mRNA sisaldab mitut ORFi ja valgusüntees toimub kõigil initsiaatorkoodoni ja Shine-Dalgarno järjestusega varustatud lugemisraamidel. Eukarüootidel on 95% mRNA-dest initsiatsioon mRNA 5’ otsale kõige lähemal asuvalt initsiaatorkoodonilt. AUG koodonite või tugevate RNA sekundaarstruktuuride tekitamine 5’ capi’i ja valku kodeeriva lugemisraami vahele inhibeerib sellelt translatsiooni või kaotab selle sootuks. Siit tuleneb klassikaline skaneeriv translatsiooni initsiatsiooni mudel, mille kohaselt seostub ribosoom mRNA-le 5’ cap-ist sõltuvalt ning koos initsiaator-tRNA-ga
annaabi.ee 
