Euroopa Liidus antakse kõik GMO toidu ja sööda turule viimise load Euroopa Komisjoni otsusega pärast Euroopa Toiduohutusameti (EFSA) ja liikmesriikide riskihindamise läbiviimist. Maaeluministeerium vastutab selle eest, et Eesti annaks Euroopa Liidu liikmesriigina turulelubamise riskihindamises oma panuse. Ministeeriumis tegutseb ka loomkatsete loakomisjon, kuhu laekuvad GMO loomade loataotlused. (Maaeluministeerium, 2015) Sotsiaalministeeriumi haldusalas olev tööinspektsioon vastutab GM mikroorganismide suletud keskkonnas kasutamise lubamise eest. (Maaeluministeerium, 2015) Eestis on kaks nõuandvat komisjoni, kes teevad GMO-de ja nendest koosnevate või neid sisaldavate toodete kohta riskihindamist. Geenitehnoloogiakomisjon – keskkonnaministeeriumi juures tegutseva komisjoni
kompleksloa taotluses · kompleksluba on tegevuskohakeskne · kompleksluba on tähtajatu; · kompleksluba on kohustuslik eelpool nimetatud tegevusvaldkondades tegutsevatele käitistele, tegevusvaldkondade alltegevusvaldkonnad ja künnisvõimsused kehtestab Vabariigi Valitsus määrusega. Millal tuleb taotleda kompleksluba? · Uued käitised peavad taotlema luba enne tegevuse alustamist. · Olemasolevad käitised peavad esitama loataotlused Vabariigi Valitsuse määruses märgitud tähtpäevaks ajavahemikus 1. maist 2003 kuni 01. jaanuarini 2007. · Käitised võivad taotleda luba ka tähtajast varem. · Õhu-, vee- ja jäätmeluba omavatel käitistel on soovi korral õigus taotleda kompleksluba. Luba peab sisaldama · Kõikide tootmisprotsesside ja tingimuste kirjeldusi · Arvesse tuleb võtta tavalist protsess, sagedasemaid õnnetusjuhtumeid, ajutisi ettenägematuid-