13 Kõrvulukustava mürinaga tõusis seitsmes Saturn-V stardiplatformilt ning kadus kiiresti pilvedesse. Ja kohe algasid ka probleemid. Rakettmootorite leek moodustas pilvedes elektrit juhtiva samba ja poole minuti pärast lõi välk. Välk lõi nii teenindustorni kui ka kosmoselaeva. Välgulöögi tõttu lülitusid välja kosmoselaeva kütuselemendid, aga õnneks kanderaketisüsteemid ei kannatanud. Esimese lennuminuti lõpus toimus teine välgulöök, seekord pilvede vahel. See põhjustas kosmoselaeva güroplatformi väljalülitamise, mis kontrollib kosmoselaeva orientatsiooni kosmoses. Aga ka seekord vedas: tõrked olid ainult kosmoselaeva süsteemides, kanderaketi Saturn-V kõik süsteemid jätkasid korralikult funktsioneerimist peale mõnede telemeetriaandurite rikkeid. Juhtunu oli selge vedamine: 1987. aastal Atlas-Centaur raketi väljalennutamise põhjustatud välgulahendus põhjustas
valitsust. Kell 9.26 annab FAA kõgile õhus viibivatele tsiviillennukitele käsu maanduda lähimas lennujaama ning sulgeb õhuruumi USA kohal. Selleks ajaks on juba teada, et senitoimunu pole kaugeltki kõik. Kell 9.24 saabub NORAD-ile FAA-lt juba piisavalt tuttav teade: veel üks lennuk on kaaperdajate võimuses, lend 77. Seegi kord sööstavad Langley Air Force baseist Virginias õhku kaks F-16 hävitajat. Kuid ka nemad ei muuda asjade käigus midagi. Mõlemad hävitajad on 12 lennuminuti kaugusel Arlingtonist, kus kell on 9.41, kui Boeing 757 tormab sealsesse Ameerika sõjaliste jõudude närvikeskusesse, Pentagoni. Aastal 1942 alustatud hoone võtab küll tuld, kuid osutub üllatavalt vastupidavaks. Sedapuhku on õnne: suur osa hoone segmentidest, mis langevad purustuste ohvriks, koosnevad enemasti tühjadest bürooruumidest, kuna just selles osas oli alustatud renoveerimistöid. Viis minutit pärast rünnakut Pentagonile evakueeritakse Valge Maja, kelle 9.48 ka Kapitoolium