DNA replikatsioon 1. Alternatiivsed mudelid 2. Poolkonservatiivne: MeselsonStahli katsed 3. DNA süntees ja elongatsioon 4. DNA polümeraasid 5. Replikatsiooni algus ja initsiatsioon 6. Prokarüootne/eukarüootne mudel (tsirkulaarne/lineaarne kromosoom) 7. Telomeeride replikatsioon Replikatsiooni alternatiivsed mudelid Ultratsentrifuugimine gradiendis 1958: Matthew Meselson ja Frank Stahli katse, milles näidati, et repliktsioon on poolkonservatiivne 1955: Arthur Kornberg Töötas E. coli'ga. Avastas DNA sünteesi mehhanismi in vitro Vajalik neli komponenti: 1. dNTPs: dATP, dTTP, dGTP, dCTP (deoxyribonukleosiid 5'trifosfosfaadid) (suhkuralus + 3 fosfaati) 2. DNA matriits 3. DNA polümeraas I (Kornbergi ensüüm) (DNA polymeraas II ja III avastati veidi hiljem) 4. Mg 2+ (optimeerib polümeraasi aktiivsuse) 1959: Arthur Kornberg (Stanford University) ja Severo Ochoa (NYU) DNA süntees: 1
Microsatelliidid( short tandem repeats e.g., TTA|TTA|TTA). Telomeerne garanteerib programmeeritud rakusurma. Kui teda enam ei ole, siis rakk hukkub. DNA replikatsioon DNA süntees toimub poolkonservatiivselt. Tõestati ära Watson.Cricki mudel. Kovalentse sideme tagamiseks nukleotiidide vahel on vajalik DNA polümeraas ning Mg ioon, mis aktiveerib polümeraasi. DNAd on võimalik paljundada ja ta säilitab oma stabiilsuse. 1955: Arthur Kornberg avastas DNA sünteesi mehhanismi in vitro. Vajalik neli komponenti: dNTPs: dATP, dTTP, dGTP, dCTP (deoxyribonukleosiid 5'-trifosfosfaadid) (suhkur-alus + 3 fosfaati) DNA matriits DNA polümeraas I (Kornbergi ensüüm)(DNA polymeraas II ja III avastati veidi hiljem) Mg 2+ (optimeerib polümeraasi aktiivsuse) DNA süntees: DNA polümeraas I katalüüsib fosfodiester sideme moodustumist deoksüriboosi 3'-OH (viimasel nukleotiidil) ja dNTP 5'-fosfaadi vahel. Energia saadakse kahe fosfaatrühma
Biochem. J. 257 (1989) 529-34. Püruvaatkinaas: Disease Pyruvate kinase-3 http://www.kegg.com/dbget-bin/www_bget?omim+179050 Pyruvate kinase, liver and RBC type http://www.kegg.com/dbget-bin/www_bget?omim+609712 Reference 1 Boyer, P.D. Pyruvate kinase. In: Boyer, P.D., Lardy, H. and Myrback, K. (Eds.), The Enzymes, 2nd edn., vol. 6, Academic Press, New York, 1962, pp. 95-113. 2 Kornberg, A. and Pricer, W.E. Enzymatic phosphorylation of adenosine and 2,6-diaminopurine riboside. J. Biol. Chem. 193 (1951) 481-495. 3 Kubowitz, F. and Ott, P. Isolierung von Garungsfermenten aus menschlichen Muskeln. Biochem. Z. 317 (1944) 193-203. 4 Strominger, J.L. Enzymatic synthesis of guanosine and cytidine triphosphates: a note on the nucleotide specificity of the pyruvate phosphokinase reaction. Biochim