·Mitteensümaatilin ·Kromosoomide analüüs toimub skaneeriva lähivälja optilise mikroskoopia (SNOM) abil ·Eelis kromosoomide ja kromatiini intaktsuse säilimine 5. COMBO-FISH (combinatory oligonucleotides) · Madaltemperatuuri FISH edasiarendus · Põhineb faktil, et 1-2% inimgenoomist on ~ 14 aluspaarised homopuriin või homopürimidiin järjestused · Proovina homopuriin või homopürimidiin oligonukleotiidid, mis moodustavad DNA-ga kolmikahela · DNA eelnev denaturatsioon pole vajalik ! Suured laigud on mittespetsiifiliselt värvunud tuumakesed 6. Fiber-FISH Kasutatakse väljavenitatud kromatiinkiudusid. Eriline lüüsipuhver, mis lõhub ka tuumamaatriksi. DNA pikeneb 130% teoreetilisest väärtusest! Lahutusvõime paar kb d! 7. Kolmedimensionaalne FISH Kromosoomiterritooriumid intaksetes interfaasi tuumades konfokaalmikroskoopia vahendusel 7.Võrdlev genoomne hübridisatsioon
skaneeriva lähivälja optilise mikroskoobi abil, eelis kromosoomide ja kromatiini intaktsuse säilimine (ehk näeb terveid kromosoome, mis kõrgemal temperatuuril katki läheks). Fragile X puhul on hea kasutada seda meetodit. COMBO-FISH: eelmise edasiarendus, põhineb faktil, et 1-2% inimgenoomist on ~14 aluspaarilised homopuriinid või homopürimidiini järjestused, proovina homopuriinid või homopürimidiini järjestused, mis moodustavad DNA-ahelaga kolmikahela, DNA denatureerimine pole vajalik. LT edasiarendus; kasutatakse lühikesi oligonukleotiide, mis mahuvad DNA ahela pöörde (groove'i) vahele pole vaja räiget DNA töötlust ja denaturatsiooni. Fiber-FISH: Lahutusvõime paar kb (väga hea!); kasutatakse interfaasi kromosoome (väljavenitatud kromosoomikiud) DNA on fiibritena, katkeb kergesti. Näha on intron-ekson struktuur. SKY-FISH: FACSis sorteeritud kromosoomid (terve karüotüüp) on eraldi purkides, neid saab
annaabi.ee 
