Ne = uk(k-1)/2 Ne - pop.suurus ajal u ; u - aja u pikkus; k - liinide arv ajal u 9. Mis on populatsiooni efektiivne suurus Ne? Nimeta mõned Ne alaliigid. Ne on indiviidide arv Wright-Fisheri ideaalpopulatsioonis, millel puhul on geenitriiv sama kiirusega, kui vaadeldavas reaalses populatsioonis. Vahel defineeritakse veel lühemalt: sigivate indiviidide arv populatsioonis. Ne on mudelpopulatsiooni suurus, milles on sama suur... geneetiline mitmekesisus ja koalestsentsiaeg alleelisageduste juhuslike kõikumiste ulatus heterosügootsuse langus ... nagu vaadeldud tegelikus populatsioonis. Alaliigid : Koalestsenti Ne, hajuvuse Ne, inbriibriidingu Ne. 10. Miks enamasti populatsiooni efektiivne suurus ei ole võrdne reaalse indiviidide arvuga (tsensuse suurusega)? Reaalsete populatsioonide erinevused Wright-Fisheri ideaalpopulatsioonist, mis mõjutavad geenitriivi: sigivate isaste-emaste suhe erineb 1:1
Koalestsentside sagedus= tõenäosus, et kahel geenil on eelmises põlvkonnas ühine eellane. Kuna koalestsentsi tõenäosus igas põlvkonnas on 1/2N, siis keskmiselt tuleb oodata 2N põlvkonda kuni kaks liini koalestseeruvad. Valem: P=1/2Ne 4. Kuidas arvutada keskmist oodatavat TMRCA ehk puu sügavust, kasutades suhtelist aega populatsioonisuuruse suhtes? Miks on genealoogiliste puude kõrgusel suur hajuvus? Natalja Sellepärast, et viimane koalestsentsiaeg on pikk ja jaotuvus on ebasümeetriline. Lisaks on usaldusintervall 95%, mis annab Ne-le väga laiad piirid, mis muudabki genealoogilise puu hästi hajusaks. 5. Kirjelda liinide koalestseerumist populatsiooni kasvamise/kahanemise korral! Kuidas see mõjutab genealoogia puu kuju? Natalja Keskmine aeg, mis kulub esimese koalestsentsini k liini puhul, on 2N/((k(k-1)/2). Populatsiooni suurenedes see aeg suureneb, seega koalestseerumise kiirus väheneb võrdeliselt populatsiooni suurenemisega.
annaabi.ee 
