Tihti baseeruvad koalesentsiteoorial. Simuleeritakse mudeli alusel andmed ja võrreldakse parametri hinnanguid simuleeritud ja reaalsete andmete vahel. 2. Kirjelda kuidas saab simulatsioone kasutades hinnata empiirilise populatsiooni sisese geneetilise varieeruvuse (π – keskmine paariviisiline erinevus) hinnangu usalduspiire. DNA järjestustest leitakse keskmine paariviisiline erinevuste arv π. Lähtuvalt koalesentsiteooriast simuleeritakse suur hulk koalesentsi puid eeldades lõputute saitide mudelit. Kasutades sedasama leitud π, paigutatakse puudele juhuslikult mutatsioonid (π/2 igale liinile – juurest tipuni). Nüüd on võimalik nende puude pealt tuletada DNA järjestused ja iga simulatsiooni kohta arvutada π. Nii same π hinnangute jaotuse millelt saame hinnata näiteks 95% usalduspiire. 3. Mida saab välja lugeda populatsiooni sisese paariviisiliste erinevuste jaotusest.
varieeruvuse (π – keskmine paariviisiline erinevus) hinnangu usalduspiire. 3. Mida saab välja lugeda populatsiooni sisese paariviisiliste erinevuste jaotusest JÜRI 4. Mis asi on asenduste sagedusspekter (Site Frecuency Spectrum) ja mida võiks järeldada kui näeme populatsioonis palju rohkem haruldasi mutatsioone kui konstantset populatsioonisuurust eeldava koalesentsi mudeli põhjal simuleeritud andmetes? Kristine Asenduste sagedusspekter ehk haplotüüpide sageduste distributsioon. See näitab sekventside hulka populatsioonis, mis esindab igat vaadeldud sekventsi alleeli (eeldusel, et individuaalid on haploidsed või homosügootsed). SFS, mida teatakse kui HFD aitab identifitseerida efektiivse populatsiooni suuruse kasvu või kahanemist kui vaadeldavad järjestused on neutraalsed.
annaabi.ee 
