β-leht – tavaliselt 5-8 aminohapet pikad, kõrvutiasetsevad ja omavahel vesiniksidemetega seotud järjestuselõigud. On kas paralleelsed (samasuunalised) või antiparalleelsed (vastassuunalised). Tõus jäägi kohta 3,47 Å (antiparal.); 3,25 Å (paral.) β-pööre – võimaldab peptiidahelal suunda muuta, ühe karbonüülrühma O on seotus vesinisidemega kolmanda jäägi amiidrühma vesinikuga, Pro+Gly Amfipaatne heeliks – kus hüdrofoobsede jäägid on klasterdunud hüdrofiilsetele diametraalselt (nn. coiled-coil kõremate struktuuride teke) 7 Valgu struktuuride kujutamise viisid Põhiskelett (C-back bone), põhiskelett koos kõrvalahelatega, lintstruktuur, ruumitäitev struktuur. Võib kujutada skeletina, „Ball and stick“ , koos sekundaarstruktuuri elementidega, pinnalaengu jaotusega. 8 Valkude modulaarsus, domäänid ja motiivid Valgud koosnevad erinevatest osadest, nad ei ole pidevad, nad on modulaarsed.
DNA replikatsiooni algust) PBCV-1 transkriptsiooni kohta on teada et: - PBCV-1 surub kiiresti ja efektiivselt maha peremeesraku transkriptsiooni (kromatiini re- modelleerimine valgu vSET poolt?). - Osa varajasi transkripte sünteesitakse ka valkude de novo sünteesi puudumisel rakus. Varajased transkriptid on polüadenüleeritud, kuid hilistest transkriptidest on polüadenüleeritud vaid üksikud. Varajased ja hilised geenid ei ole klasterdunud. DNA replikatsioon algab 1 tund peale infektsiooni algust. Raku tuuma ja kloroplasti DNA degradeerub, kuid DNA sisaldus rakus tõuseb (4 tundi peale infektsiooni algust) tänu viiruse DNA aktiivsele replitseerumisele 4-10 kordseks (seda võimaldab viiruse nukleotiide sünteesivate valkude olemasolu, selliseid ensüüme on vähemalt 13). Replikatsiooni viib läbi viiruse kodeeritud ensüümkompleks (vähemalt kümne viiruse geeni produktid, sh polümeraas, ligaas,
mille aluseks on 10 nm kromatiini fiiber. Näitasid, et interfaasi tuum on kompartmentaliseeritud kindlateks kromosoomi territooriumiteks (CT). Kromosoomide territooriumite pinnad ja nende vahelised alad moodustavad võrgustiku-laadse 3D tuuma sektsiooni geeniekspressiooniks, mRNA splaissinguks ja transpordiks mida nim interkromatiini kompartmendiks (IC). 10 nm fiiber ebakorrapärases olekus, mis on dünaamilise liikumisega või klasterdunud CT-tes avatud ja suletud kompartmentite gloobulites. Mudeli kohaselt asuvad aktiivsed geenid territooriumite pindadel ning mRNA transkriptid vabanevad IC ruumi. Kromatiini domeenid on kromosoomide territooriumite komponendid. Interkromatiinne kompartment esineb kromatiini domeenide vahel, see on DNA-vaba piirkond ning sisaldab splaissimise spekleid. Perikromatiinses ruumis toimub perikromatiini fibrillide tootmine. Iga fibrill kannab vastset
annaabi.ee 
