Selline pedagoogika viis peab õpilast õpetama õpetajat kartma ja armastama. Neljateistaastasena siirdus ta edasi Magdeburgi toomkooli. Selle kooli õpetajad olid vagad mehed, ning nende õpetuse eesmärgiks oli moodne vagadus lakkamatu püüa täiuslikkusele. Arvatakse, et juba seal puutub Luther kokku piibliga või evangeeliumitega. Selles kooli õppis ta siiski vaid aasta ning seejärel saatis isa ta Eisenachi kooli. Leiva teenimiseks oli ta kerjuslaulja, mis sel ajal polnud üldse häbiasi, sest leiba paluti Jumala nimel. Siiski viimased koolipoisi aastad elab ta vagade heategijate juures õnnelikus õhkkonnas, kus tal on võimalus õpingutele pühenduda. Kuna ta oli juba eelmises koolis silmapaistvate tulemustega tundus samm ülikooli astuda igati loogilisena. Aastal 1501, mils ta oli 19- aastane astus ta Erfurti ülikool, mis oli üks hinnatumaid. Isa Hans soovis, et poes õpiks õigusteadusi, sest sellel alal on jõukus paremini
hiliskeskaegset äratuslikku vagadust. Lutheri mälestustesse jääb see kui kõige puhtam katoliku usumaailm. Arvatakse, et juba seal puutub Luther kokku piibliga või evangeeliumitega. Selles kooli õppis ta siiski vaid aasta ning seejärel saatis isa ta Eisenachi kooli, kus ta õppis aastatel 1498 1501. Eisenachi heas kuulsuses olevas koolis antakse õpetust humanistlikus vaimus. Luther õpib hindama vanu klassikuid. Leiva teenimiseks oli ta sel ajal kerjuslaulja, mis polnud üldse häbiasi, sest leiba paluti Jumala nimel. Omanuna meeldivat välimust ja ilusat häält, ei ole Martinil raske heades südametes kaastunnet äratada. Siiski viimased koolipoisi aastad elab ta vagade heategijate juures vaimselt puhtas ja õnnelikus õhkkonnas, kus tal on võimalus õpingutele pühenduda. Ta hakkas kaasõpilaste seas andekuse poolest silma ning endastmõistetavalt siirdub ta sealt edasi ülikooli. Aastatel 1501 1502 õpib ta Erfrudi ülikoolis