1. MP metoodi kasutamisel arvutada fülogeneetilised puud kasutades järgmisi programme: a. DNAPARS b. DNAPENNY c. DNAMOVE d. Joonistada välja juurtega (DRAWGRAM) ja juurteta puu (DRAWTREE). Joonistamisel tuleb valida Bitmapi formaat resolutsiooniga 640 ja 400. 2. Kaugusmeetodite kasutamisel moodustada kõigepealt kaugusmaatriks kasutades DNADIST ning puud arvutada järgmiste programmidega: a. FITCH b. KITSCH c. NEIGHBOR d. Joonistada välja juurtega (DRAWGRAM) ja juurteta puu (DRAWTREE). 3. ML meetodi kasutamisel teha kõigepealt MSA-le bootstrapping (SEQBOOT) ning seejärel arvutada fülogeneetilised puud kasutades
060290 DRAWTREE: b) DNAPENNY DRAWGRAM: DRAWTREE: Kristina Raud YAGB-41 060290 c) DNAMOVE DRAWGRAM: DRAWTREE: Kristina Raud YAGB-41 060290 2. Kaugusmeetodite kasutamisel moodustada kõigepealt kaugusmaatriks kasutades DNADIST ning puud arvutada järgmiste programmidega: Vastus: Kaugusmaatriks: 5 eco_b0201 0.000000 0.001298 0.011146 0.023964 0.028571 ece_Z0213 0.001298 0.000000 0.011146 0.023963 0.028570 sfl_SF4435 0.011146 0.011146 0.000000 0.027387 0.019786 stm_STM024 0.023964 0.023963 0.027387 0.000000 0.008521 spt_SPA025 0.028571 0.028570 0.019786 0.008521 0.000000
annaabi.ee 
