mosaiikmudel orgaanilised solvendid Puhastatutena käituvad kui vees Perifeersed membraanvalgud- seotud membraaniga kindlal poolel detergendid lahustuvad valgud Integraalsed membraanvalgud- paiknevad osaliselt või täielikult membraani sees kaotroopsed ained Tsütokroom C Ka membraanivalgud võivad lateraalselt difundeeruda, ehkki aeglasemalt kui lipiidid. Tavaliselt agregeeruvad vees Flip-flop liikuvus ja membraani faasist lahkumine / liitumine on takistatud Membraanitransport
Integraalsed membraanivalgud Perifeersed membraanivalgud Seotud tugevalt lipiididega hüdrofoobsete Dissotsieeruvad membraanide küljest interaktsioonide vahendusel lihtsamalt, näiteks kõrge ioonse jõu või pH Eraldatavad vaid membraanide lõhkumisega muutuse tagajärjel. orgaanilised solvendid Puhastatutena käituvad kui vees detergendid lahustuvad valgud kaotroopsed ained Tsütokroom C Tavaliselt agregeeruvad vees Integraalsete membraanivalkude struktuur Integraalsed membraanivalgud on amfifiilsed: membraanis paiknevad hüdrofoobsed aminohappejäägid väljaspool lipiidset kaksikkihti asuvad eelkõige hüdrofiilsed jäägid Erütrotsüütides esinev glükoforiin: 3 domeeni 1. N terminaalsed 72 ah jääki ekstratsellulaarses osas ulatuslikult glükosüleeritud 2
50% valgumolekulidest denatureerunud Valkude denaturatsioon on kooperatiivne protsess Valkude denaturatsioon ja renaturatsioon Denatureerivad faktorid 1. Temperatuur. Termiline denaturatsioon on kooperatiivne. Muna keetmine 2. pH HCl maos 3. Detergendid 4. Kaotroopsed ühendid (Guanidiinium ioon, karbamiid) Väiksemad valgud denatureeruvad reeglina pöörduvalt Suuremad valgud kalduvad denatureerudes agregeeruma ja selline denaturatsioon on pöördumatu Valkude kokkupakkumise kineetika Levinthali paradoks: väikese valgu (ribonukleaas, 124 ah) puhul on võimalik ligikaudu 1050 erinevat konformatsiooni. Kui valk kulutaks iga konformatsiooni läbiproovimiseks 1013 sekundit, siis kuluks kõikide proovimiseks 1030 aastat
Denatureerunud valgul on palju kõrgem konformatsiooniline entroopia, omab palju vabadusastmeid kõrgematel temperatuuridel on entroopia osakaal suurem (Gibbsi vabaenergias). pH mõjutab, sest laeng-laeng interaktsioonid võivad ära kaduda detergendid molekulid, mis omavad hüdrofiilset ja hüdrofoobsed osa. Valkudes on hüdrofoobsed osad valgu sees, detergendid aga stabiliseerivad ka denatureerunud olekus valke. Kaotroopsed ühendid mood vesiniksidemeid 63 Pöörduv denaturatsioon- esineb tasakaal natiivse ja denatureerunud oleku vahel. Näidatud on, et valgu denaturatsioon on pöörduv, kui tingimused tagasi viia loomulikku vahemikku, siis valk omandab natiivse struktuuri. ND Valgu kolmemõõtmelise struktuuri kohta käiv info sisaldub valgu primaarstruktuuris. Esineb seos valgu primaarstruktuuri ja ruumilise struktuuri vahel