RNA-polümeraas transkribeerib DNA'd (- alaühik initsieerib sünteesi), kuid toodab umbes 10 "värdjalikku" (lühike, mitteproduktiivne) transkripti. Need transkriptid ei saa polümeraasist väljuda, kuna väljapääs on blokeeritud -faktoriga. Lõpuks -faktor dissotseerub holoensüümist ja järgenb elongatsioon. Eukarüoodi transkriptsiooni initsiatsioon: Eukarüootide promootor on tavliselt 50 aluspaari ülavoolu transkriptisooni intsiatsiooni saidist. Koosneb see basaalsest transkriptsiooni-kompleksist ja RNA-polümeraas II-st. Edasine transkriptsiooni regulatsioon on teostatud ülavoolu kontrollielementidega, tavaliselt asuvad nad umbes 200 aluspaari ülavoolu initsiatssiooni saidist. Promootorjärjestus sisaldab vahel TATA-box'i kõrgelt konserveerunud DNA äratundmisjärjestus TATA-box-seonduvatele valkudele (TATA box binding protein), milledee sidumine initsieerib transkriptsioonikompleksi kokkupanekut promootorile
110 kD), IF-3 ja IF-1 on väikesed valgud (9 ja 25 kD vastavalt). IF-2 ja IF-3 esinevad kõigil bakteritel. IF-2 seob GTP juuresolekul initsiaator-tRNA'd, mis bakterites on fMet-tRNAfMet. Sellise kolmik-kompleksina seondub IF-2 ribosoomi väiksema subühikuga ja moodustab viimasega stabiilse kompleksi. IF-2 on GTP'd siduv valk ja tal on teistele GTP'ga seonduvatele valkudele omane valgudomään nn. GTP domään. IF-2 omab GTP'd hüdrolüüsivat tsentrit, mis aktiveerub intsiatsiooni käigus ja on sõltuv ribosoomide suuremast subühikust. IF-3 on ribosoomide dissotsiatsioonifaktor, ta takistab ribosoomide subühikutel assotseerumast, võimaldades niiviisi vabade 30S subühikute olemasolu, mis on vajalikud mRNA ja IF-2.GTP.fMet-tRNAfMet kompleksi sidumiseks. Initsiaator-tRNA, mis prokarüootides on fMet-tRNAfMet, erineb veidi tavalistest tRNA'dest. Esimene nukleotiid ei ole initsiaator-tRNA's paardunud. Teistel tRNA'del on esimene nukleotiid paardunud 72. nukleotiidiga
matriitsahel saaks paarduda RNA ahelasse lülitatavate ribonukleotiididega; (3) Algab RNA ahela süntees, kus kasvavasse RNA ahelasse lülitatakse kuni 10 nukleotiidi, ilma et RNA polümeraas DNA ahelal edasi liiguks (abortiivne transkriptsioon). RNA polümeraas on DNA-l võimeline edasi liikuma alles siis, kui sigma faktor vabaneb. Siis algab RNA ahela elongatsioon. Transkriptsiooni intsiatsiooni kohta DNA järjestusel (märgib nukleotiidi asukohta, millest algab esimese nukleotiidi lülitamine RNA ahelasse) tähistatakse +1. Kõigi nende nukleotiidide asukohti DNA-s, mis jäävad initsiatsioonisaidist ,,ülespoole", seega 5´ suunas, näidatakse ,,-" märgiga, mis aga jäävad ,,allapoole", näidatakse ,,+" märgiga. Järgnevalt leiab täpsemat käsitlust bakteris Escherichia coli toimuv transkriptsiooni initsiatsioon. Bakteris E
matriitsahel saaks paarduda RNA ahelasse lülitatavate ribonukleotiididega; (3) Algab RNA ahela süntees, kus kasvavasse RNA ahelasse lülitatakse kuni 10 nukleotiidi, ilma et RNA polümeraas DNA ahelal edasi liiguks (abortiivne transkriptsioon). RNA polümeraas on DNA-l võimeline edasi liikuma alles siis, kui sigma faktor vabaneb. Siis algab RNA ahela elongatsioon. Transkriptsiooni intsiatsiooni kohta DNA järjestusel (märgib nukleotiidi asukohta, millest algab esimese nukleotiidi lülitamine RNA ahelasse) tähistatakse +1. Kõigi nende nukleotiidide asukohti DNA-s, mis jäävad initsiatsioonisaidist ,,ülespoole", seega 5´ suunas, näidatakse ,,-" märgiga, mis aga jäävad ,,allapoole", näidatakse ,,+" märgiga. Järgnevalt leiab täpsemat käsitlust bakteris Escherichia coli toimuv transkriptsiooni initsiatsioon. Bakteris E
annaabi.ee 
