Sünteesi käigus hoiab RNA polümeraas enda käes 8-nukleotiidilist heterodupleksi (RNA ja DNA hübriid). Juuksenõelastruktuur peab olema piisavalt pikk, et dissotseeruda RNA polümeraasi kompleks DNA-lt. Kaksikahel (RNA-RNA – juuksenõela moodustumisel) on stabiilsem kui RNA-DNA heterodupleks. Sellise järjestuse puhul kus on AT paar, selle koha pealt võib RNA kergelt dissotseeruda ja produkt vabaneb. Siis ka süntees katkeb. Rho sõltuv faktor moodustab heksameere ja seondub RNA-ga. Liigub mööda ahelat kuni RNA polümeraasini, kui selles on sünteesitud kindel järjestus (mis on rho-le ATP hüdrolüüsi signaaliks), tunneb järjestuse ära. Moodustab heksameerse kompleksi ja äratundmisjärjestusega suunab RNA ahela lõikamise. RNA ahel vabastatase transkriptsioonikompleksist. Toimub sigmafaktori vahendusel, mis moodustab heksameere. Seondub sünteesitava RNA 5’ otsaga ja hakkab liikuma 5’ → 3’ suunas, jälitab polümeraasi
osa valgust on seotud piili biogeneesiga. T4SS ATPaasid T4SS-l on 3 ATPaasi, mis tagavad substraadi transpordi: VirB4, VirB11 ja VirD4. VirB4 konjugatsiooniaparaadi levinud ATPaas, seda on konserveerunud nii G(-) kui ka G(+) bakteritel. VirB4 on sisemembraanivalk, mis interakteerub VirB3, 6, 7 ja 8-ga. C-terminaalne domeen on tugevalt konserveerunud, ATPaasne aktiivsus. Eraldiseisvana dimeriseerub, kuid on leitud ka monomeere, trimeere ja heksameere. VirB11 AAA+ perekonna heksameerne liikuv ATPaas, mis on T4SS moodustumiseks ja konjugatsiooni toimumiseks asendamatu. Seotud sisemembraaniga, moodustab heksameeridest ringja struktuuri, seondub nii VirB4 kui ka VirD4-ga. Seondudes VirB4-ga initseerib piili biogeneesi, seondudes VirD4-ga sunnib T4SS-i seonduma translokeeritava substraadiga. VirD4 suur sisemembraaniga seotud valk, millel on kaks domeeni: N-
annaabi.ee 
