kontiigide endi pikkuste järgi, mis on umbkaudu teada. Koostuprogrammid jagunevad skäffoldimisetapi läbiviimisel kahte erinevasse suunda. Esinevad nii kaks-ühes koostud, mis sisaldavad juba skäffoldimismoodulit, kuid nende kõrval esineb programme, mis on just spetsiaalselt skäffoldimise jaoks disanitud. Kuigi pakub kaks-ühes programm kasutajamugavust, ei ole see alati kõige õigem viis genoomi järjestuse lõpetamiseks, sest universaalset, kõikidele genoomidele sobivat lähenemisviisi, ei ole veel leitud. Sellise programmi rakendamisel on kasutajatel vähe kontrolli skäffoldimisprotsessi üle ja informatsiooni tootmise suunamist ei saa kontrollida. Eraldiseisvad skäffolderid on paindlikumad ja võimaldavad kontrollida skäffoldimisparameetrite rakendamist. Esimene täielikult lõpetatud elusorganismi genoom kuulub Haemophilus influenzaele, kelle genoomi suuruseks on 1,89 Mb. Shotgun genoomi projekt hõlmab endas mitut järku: DNA murdmine
Transgeenne analüüs organismi viiakse sisse võõrgeen, mida seal hakatakse ekspresseerima, näiteks viirusvektorite abil saab; kui on vähe rakke, siis rekombinantse DNA meetod. 39. Defineeri enhancer ja loetle enhanceri omadused. Missuguseid analüüsimeetodeid kasutatakse enhanceralade tuvastamiseks? Kauguste-tagant mõjuvad regulaatorelemendid on enhancer-id, mis on eukarüootsetele genoomidele väga iseloomulikud, samas kui bakteris nad peaagu täielikult puuduvad. Asuvad sadade kuni tuhandeteid aluspaaride kaugusel start-saidist, võivad asuda nii ülavoolu, intronites kui ka allavoolu. Enhancer'id on üldreeglina 50bp kuni 200bp pikad DNA järjestused sisaldades hulgaliselt transkriptsioonifaktorite sidumissaite. Arvatakse, et need TFid, mis ühele enhacer'ile seovad, interakteeruvad ka omavahel. - interferooni (valk, mis inimesel on viirusinfektsiooni blokkijaks) ca 70bp
annaabi.ee 
