soodustab tuppe kaitset võõraste mikroobide eest. § Mikrobioota tupes muutub sõltuvalt hormonaalsest (menstruatsiooni) tsüklist. Seedekulgla mikrobioota § Varieerub vertikaalselt ja horisontaalselt. § Horisontaalne erinevus - mõned liigid seostuvad limaskestaga (tropism), teised rohkem valendikus. § Gram-positiivsed (laktobatsillid, streptokokid) seostuvad limaskestale polüsahhariidse kihnu ja rakuseinas oleva teihhoiinhappe abil. Gramnegatiivsed bakterid seostuvad peamiselt fimbriatega. § Ülemises osas vaid süljega ja toiduga neelatud mikroobid. Magu happeline, seal mikroobe harva, peamiselt laktobatsillid. Peensoole ülemine osa suhteliselt vähe, valdavalt Gram- positiivne (Lactobacillus, Streptococcus faecalis jt.). Hulk 105-107 bakterit/ml. Alumises peensoole osas rohkem 108/ml. Lisanduvad uued liigid (Bac-teroides). Jämesooles 1011/g kakas. Palju Enterobacteriaceae sugukonda (E. coli), Clostridium, Streptococcus, Lactobacilllus
Salmonellaga saastunud toit maitselt ei muutu. *Klebsiella nimetatud Saksa mikrobioloogi Edwin Klebsi auks. Klebsiella pneumoniae (kopsupõletik). Paks kapsel, liikumatus, ureaasid. Klebsiella mobilis, K. oxytoca, K. plancticola. Klebsiella elukoht: mullas, taimedel, vees. Klebsiellat saab isoleerida ka taimejuurte pinnalt, kus nad fikseerivad N2. Nad on assotsieerunud mitteliblikõieliste taimede juurtega. Teised enterobakterid ei fikseeri N2. Rakud kleepuvad juurekarvakestele fimbriatega. Klebsiella tüved, mida isoleeritakse taimsest materjalist ja mullast erinevad nendest tüvedest, mis põhjustavad haigust inimesel. Neil on erinev näiteks kapsli koostis. 9 Klebsiella infektsioonid inimesel. Klebsiellat on paljude tervete inimeste kurgus ja väljaheidetes. Klebsiella on ka sage haiglainfektsioonide põhjustaja. K. pneumoniae