mitmeid väga häid saavutusi. 1996. aastal jõudis Martin Müürsepp koos Eesti klubiga Tallinna Kalev Eesti Korvpalli Meistriliigasse. See oli tema jaoks suur saavutus. Aastatel 1999-2005 mängis Martin Müürsepp välismaa klubides. 2000. aastal võitis ta Kreeka korvpalliklubiga AEK Ateena Saporta karika. Sama klubiga saadi teine karikas ka kohe järgmisel aastal. 2004. aastal võitis Martin Müürsepp Venemaa klubi UNICS Kazan koosseisus FIBA EuroCupi. Ja järgmisel aastal pääses ta koos Venemaa klubiga Moskva CSKA Venemaa Meistriliigasse. Üks aasta hiljem võitis Martin Müürsepp klubiga Moskva CSKA-ga Venemaa korvpallikarika. Teisel korral jõudis Martin Müürsepp Eesti Korvpalli Meistriliigasse 2007. aastal. Siis mängis ta Eesti klubis Tartu Rock. Individuaalsed saavutused: 2004. aastal sai ta Venemaa UNICS Kazani klubis olles FIBA EuroCupi finaalide MVP.
Koos AEK-ga on Müürsepp võitnud võitnud Saporta karika 2000. aastal ning 2000. ja 2001. aastal Kreeka korvpalli karika. Ateena AEK eest viskas Müürsepp keskmiselt 9,2 punkti ja hankides 2,7 kaitselauapalli.2001-2002 hooajal liitus Müürsepp Venemaa korvpalli Meistriliiga klubi Kazan UNICS'iga. Kazaniga lõpetas Müürsepp hooaja hõbemedaliga jäädes alla ainult Moskva CSKA-le. Järgmisel 2003-2004 hooajal mängis ta Kazaniga 2004. aasta FIBA EuroCupi finaalides ning ta hinnati Finaalide Kõige Väärtuslikumaks Mängijaks. Müürsepp jäi Moskva CSKA juhtkonnale silma ja palgati Venemaa meistriklubisse mängima. Ta mängis Moskva CSKA-s 2004-2005 aastal ning selle klubiga tuli ta Venemaa meistriks. Järgmisel aastal siirdus Müürsepp tagasi UNICS Kazani. 2006-2007 hooajal liitus Müürsepp kodumaa Meistriliiga, Tartu Rocki kossseisu. KML finaalides alistati BC Kalev Cramo mängudega 4-2. Pärast ühe hooaja mängimist Eestis, siirdus