hüdrolüüsi). ● 43S kompleksi seondumine mRNA-ga. Ribosoomi väike subühik saab mRNA kompleksiga kokku. mRNA docking on the 43S - mRNA on ümber ribosoomi väikese subühiku kaela keeratud. ● mRNA skanneerimine AUG koodoni leidmiseks. Kogu kompleks hakkab liikuma ja otsima start-koodonit. eIF4E on siiani seotud CAP-struktuuriga, GTP hüdrolüüsi indutseerimisel lahkub eIF2. ● 80S kompleksi assambleerimine. eIF5B (GTPaas) toob ribosoomi suure subühiku ning sel ajal lahkuvad osad eIF-id (PILDILT). eIF5B ühendab subühikud, seejärel vabanevad initsiatsioonifaktorid. Tõenäoliselt jääb eIF4E siiski CAP-struktuuri külge ning samuti mRNA rõngas ei tohiks laguneda. cap-sõltuva ja sõltumatu translatsiooni initsiatsiooni võrdlus. Miks kasutada IRES-t ? CAP-dependent initiation. Initiation of translation usually involves the interaction of
mRNA-l puriinide) kui ribosoomis on ainult 1 tRNA, siis on sellelt võimalik valepaardumine. Initsiatsioonil on valepaardumine tõenäolisem, kui elongatsioonil. Eukarüootide mRNA 25 Prokarüootides toimub RNA-RNA interaktsiooni abil initsiaatorsaidi leidmine . Eukarüootides toimub skaneerimisprotsessi kaudu, osaleb palju rohkem translatsiooni initsiatsiooni faktoreid. eIF2 – seob initsiaatori ja GTP, aga tal on ka väike abifaktor eIF5b, mis aitab ribosoomi subühikute assotsiatsioonil (IF-3 homoloog on eIF3 – mõlemas sama funktsioon - takistab mittetranskribeeruvatel ribosoomidel kokku minna. Eukarüootides ei ole formüülgruppi metioniini küljes – prokarüootidel on. Moodustub 43S pre-initsiatsioonikompleks. eIF4F kompleks seostub 5’ cap-ga. eIF4 – seostub mRNA-ga, aga eIF-1, eIF-3, eIF-5 → seostuvad ribosoomidega. Koos mRNA-ga moodustub kokku 47S initsiatsioonikompleks (mRNA + valgud).