Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse
Sulge

"eelasseisund" - 2 õppematerjali

Populatsioonigeneetika eksam
68
doc

Populatsioonigeneetika eksam

“päritolumustrist”, mis maksimaalselt vähendab HWE ja ahelduse (LD) tasakaalutust. ADMIXTURE konstrueerib uurija poolt defineeritud arvu hüpoteetilisi algpopulatsioone ja hindab igale uuringusse kaasatud proovile tõenäosuse millega ta pärineb igast ühest neist hüpoteetilisestest algpopulatsioonidest. 7. Kirjelda Patterson’i D (või ABBA – BABA) testi. Kasutame välisgrupi genoomi, et määrata eelasseisund igas genoomi positsioonis. Seejärel loeme kokku mitmes positsioonis jagab testgenoom sama nukleotiidi populatsiooniga A või B. Saame teada kummaga on testpopulatsioon sarnasem. 8. Mis on haplotüüpidel põhinevate meetodite nagu näiteks finestructure peamine eelis genotüübi andmetele tuginevate meetodite ees. Haplotüübianalüüs – erinevuste vaatlemine iseloomuliku mustrina koos

Bioloogia → Geneetika
34 allalaadimist
Populatsioonigeneetika 2014
52
doc

Populatsioonigeneetika 2014

kohta üks tulp. Tavaliselt sooritatakse analüüs läbi paljude k väärtustega, et jälgida struktuuri muutumist läbi erinevate k väärtuste. Selle struktuuri hierarhilisuses sisaldub ka fülogeneetiline info, kuid kahjuks mitte ainult. Mida me näeme, on siiski lihtsalt erinevuste struktuur erinevatel resolutsiooni astmetel. 7. Kirjelda Patterson’i D (või ABBA – BABA) testi. (Ahto) Kasutame välisgrupi genoomi, et määrata eelasseisund igas genoomi positsioonis. Seejärel loeme kokku mitmes positsioonis jagab testgenoom sama nukleotiidi populatsiooniga A või B. Saame teada kummaga on testpopulatsioon sarnasem. Näide: H1, H2 ja H3 märgivad 3 inimpopulatsiooni ning testi kasutatakse, et hinnata, kas andmed on kooskõlas nullhüpoteesiga (milleks on siis nt puu: ((H1, H2), H3), šimpans ning et pole toimunud geenivoolu H3 ja H1 vahel või H3 ja H2 vahel). Järgnevalt arvutatakse D statistiku väärtus:

Bioloogia → Bioloogia
6 allalaadimist


Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun