Aeroobne hingamine hapnikurõhk vähemalt 5 millibaari Anaeroobne hingamine toimub 1-5 millibaarise hapnikurõhu korral Kui hapnikurõhk jääb alla 1 millibaari, lülitub metabolism fermenteerimisele Sõltuvalt hapniku kontsentratsioonist on aeroobsel hingamisel aktiivne kas tsütokroom o või tsütokroom d oksüdaas: 1) kõrge hapniku kontsentratsioon aktiivne on hapniku suhtes madala afiinsusega tsütokroom o oksüdaas (kodeeritud geenide cyoABCDE poolt) 2) Madal hapniku kontsentratsioon aktiivne on hapniku suhtes kõrge afiinsusega tsütokroom d oksüdaas (kodeeritud geenide cydAB poolt) Vastavate geenide transkriptsiooni reguleerib ArcB/ArcA 2-komponendiline süsteem. Mõlema tsütokroomi geenid on Fnr poolt represseeritavad. Muutused geeniekspressioonis kui energiat genereeritakse ühel viisil, on teiste energia genereerimisviisidega seotud geenid represseeritud. 1) Erinevate reduktaaside geeniregulatsioon
sisalduvale FMN-le tekib FMNH2. 2) Elektronide ülekanne Fe-S rühmale. Selle käigus vabaneb 2 prootonit H+, genereerides prootonpotentsiaali (proton motive force PMF). 3) Elektronide ülekanne Fe-S rühmalt ubikinoonile, 2 elektroni (2 e -) ja 2 prootoni (2 H+) ülekande tulemusena moodustub hüdrokinoon. 4) Kui hapniku hulk on kõrge, kantakse elektronid hüdrokinoonilt tsütokroom o kompleksile (kodeeritud geenide cyoABCDE poolt). Raku väliskeskkonda vabaneb 2 prootonit (2 H +), suurendades prootonpotentsiaali. Vähese hapniku korral antakse elektronid tsütokroom d kompleksile (kodeeritud geenide cydAB poolt), mis sisaldab hapnikule kõrge afiinsusega terminaalset oksüdaasi. Sel juhul on madala afiinsusega terminaalset oksüdaasi sisaldav tsütokroom o kompleks represseeritud ja tsütokroom d kompleks indutseeritud. Vastavate geenide transkriptsiooni reguleerib ArcB/ArcA 2-