Nad saatsid kirja Galileo isale. Vana muusik manitses poega õpetajate sõna kuulama ja lõpetama tundmatute asjadega mängimine. Kuid Galileo ei teinud hoiatusest väljagi. Galileo õppejõud keeldusid talle andmast ülikoolidiplomit. Seetõttu lahkus ta Pisa ülikoolist kui meditsiinis läbikukkunu ja ,,segane mõttetustega mängija". Kuid just see mõttetustega mängimine oli talle toonud suure kuulsuse Itaalia juhtivate matemaatikute Giuseppe Moletti, isa Christoforo Clavio ja Guidubaldo del Monte hulgas. Ta oli nendega kirjavahetuses, edastades neile oma vaatlustulemusi. Nende hulgas nimetati Galileod ,,tänapäeva Archimedeseks". Kuid see oma aja Archimedes leidis, et matemaatika on meditsiinile vilets aseaine. Sel perioodil olid paljud inimesed haiged, vähesed aga uudishimulikud. Galileo püüdis leida aadlikest õpilasi, ent neid, kes olnuks valmis abstraktseid numbreid või ja leiva vastu vahetama, polnud kuskilt leida.
Ta soovis igas mõttes vaba olla. Nii füüsiliselt kui ka vaimselt. Viimaks sai siiski ülikooli võimudel villand sellest noorest mässajast ning nad otsustasid üksmeelselt, et Galileo ei ole sobiv inimene noortele õpetuse jagamiseks. Kuid nad ei söendanud seda Galileole endale nii öelda, nad leidsid ettekääne tema ametist vabastamise jaoks. Nii löödigi Galileo Pisa ülikoolist välja. Kuid õnneks oli tal sõpru - Moletti, del Monte, Clavio ja teised matemaatikud, kes olid jälginud tema nn geniaalseid eksperimente. Nad hindasid neid väga. Nende abiga leidis Galileo parema töökoha Padova ülikoolis. Palk oli kõvasti suurem, Galileo jaoks lausa enneolematult suur. Kuid palgast rohkem hindas ta oma suuremaid vabadusi. Padovas lasti tal vabalt sõna võtta, ilma teda mahategemata. 1592. aasta 7. detsembris pidas ta oma esimese loengu. Tema kolleegid kui ka õpilased ennustasid talle õppetoolis suurt tulevikku