kodeerides lühemaid valke d. *polüadenüleerimine mRNA 3' otsa lisatakse polü A-saba (kaitseb eksonukleaaside eest), enne toimub 3' otsa lõikamine e. *transport tuumast tsütoplasmasse läbi pooride tänu mRNA polü A-sabale. 23. Nimeta keemilised reaktsioonid, mis on pre-mRNA splaisingu taga. Missugused on need 3 staadiumit, mida katalüüsib splaisosoom? a. Transesterfikatsioon - *branchpointi A 2'-OH ja introni 5'-otsa fosfaatrühma-vaheline 2'5'-fosfodiesterside*ligeeritakse 2 eksonit 3'5'-fosfodiestersidemega b. Vabaneb lasiaadistruktuuriline intron, mis lagundatakse kohe Rnaaside poolt. 24. Missugused U snRNAd osalevad pre-mRNA splaisingu regulatsioonis? a. U1, U2,U5U6U4 ja U1U4. 25. Mis on GT-AG reegel? a. Intron algab alati GT'ga ja lõppeb AG'ga. 26. Kirjelda mehanismi, mille abil tuumsest pre-mRNAst kõrvaldatakse intronid.
48. Inimese BDNFi geen on enam kui 80,000 aluspaari pikkune. BDNFi mazhoorsed transkriptid aga 1.8 ja 4.4 kb pikad. Millest selline geeni versus mRNAde pikkuse erinevus on tingitud? Kirjelda molekulaarseid protsesse, mis on selle pikkuste erinevuse taga. Mittekodeerivad RNA alad on väga suured. Inimese genoomis on eksoni keskmiseks pikkuseks 150bp, samas kui introni keskmiseks pikkuseks on ca 3500bp. Pikimad intronid on kuni 500kb pikad. Kuna 5' ja 3' splaissaitide ja branchpointi järjestused on suhteliselt kõdunud, siis pikkades intronites esineb neid järjestusi mitmete koopiatena. Järelikult on vaja veel mingit lisainformatsiooni, et eksoni piire ära tunda. Eksoni rekognitsiooni kompleksne mehanism hõlmab SR valkude aktiivsust. SR valgud interakteeruvad eksoni järjestustega, mida nim. eksoonseteks splaisingu võimendajateks (exonic splicing enhancer). SR valkudel on üks või enam RRMi ning mitu valk-valk