map00710+2.7.1.40 Insulin signaling pathway http://www.kegg.com/dbget-bin/show_pathway?map04910+2.7.1.40 Type II diabetes mellitus http://www.kegg.com/dbget-bin/show_pathway?map04930+2.7.1.40 d. Leida vastavate geenidega seotud ensüümide klassid, aminohappelised järjestused, EC number. Aldolaas: EC 4.1.2.13 Class Lyases Carbon-carbon lyases Aldehyde-lyases Escherichia coli K12 MG1655: >eco:b2097 fbaB, dhnA; fructose-bisphosphate aldolase class I [EC:4.1.2.13]; K01623 fructose- bisphosphate aldolase, class I (A) MTDIAQLLGKDADNLLQHRCMTIPSDQLYLPGHDYVDRVMIDNNRPPAVLRNMQTLYNTG RLAGTGYLSILPVDQGVEHSAGASFAANPLYFDPKNIVELAIEAGCNCVASTYGVLASVS RRYAHRIPFLVKLNHNETLSYPNTYDQTLYASVEQAFNMGAVAVGATIYFGSEESRRQIE EISAAFERAHELGMVTVLWAYLRNSAFKKDGVDYHVSADLTGQANHLAATIGADIVKQKM AENNGGYKAINYGYTDDRVYSKLTSENPIDLVRYQLANCYMGRAGLINSGGAAGGETDLS DAVRTAVINKRAGGMGLILGRKAFKKSMADGVKLINAVQDVYLDSKITIA
genereerimine, aminohapetega varustatus ning valgusüntees on metabolismi peamised moodulid, mida on palju uuritud. Vaatamata sellele, et bakterid on väga erinevad, on metabolismi ülesanne universaalne ning regulatsiooni vooluringi sisend ning väljund tihti sarnased. Enamikul bakteritest on kolm metaboliiti, mis on metabolismi koordineeritud regulatsioonis tsentraalse tähtsusega, nendeks on: fruktoos-1,6-bifosfaat (FBP, inglise keeles fructose- 1,6-bisphosphate), glutamiin (Gln) ja ATP. Kuigi metaboliidid on ühised, võib regulatsiooni sisend ja väljund erineda, mistõttu bakterite metabolismi regulatsioon on erinev. Metabolismi mudelorganismideks on E. coli ja Bacillus subtilis. 5.1. Metabolismi regulatsioonietapid Metabolismi võib reguleerida põhimõtteliselt kolmel viisil: 1. Substraadi kättesaadavusega 1.1. substraadi kontsentratsioon ning transport, induktori välistamine 2. Ensümaatiliselt 2.1