Immuunsüsteemi funktsioon: kaitse haigustekitajate eest (neid elimineerides); tolerantsus oma kudede suhtes (tüvirakkudest genereeritud T ja B lümfotsüütide abil; TCR ja BCR oluline roll); st immuunsüsteemi põhiülesanne on eristada oma ja võõrast. Immuuntolerantsus – mehhanismid, mis tagavad antigeenspetsiifilise adaptiivse immuunvastuse (B ja T-rakud) vältimise või supresseerimise kehaomaste antigeenide ehk potensiaalsete autoantigeenide suhtes kahjutute võõrsubstantside (näit kommensaalsed toidubakterid, toiduantigeenid) suhtes. Tsentraalne tolerantsus – arenevate (ebaküpsete) lümfotsüütide positiivne ja negatiivne selektsioon primaarsetes lümfoidorganites: a)T-rakud tüümuse; b)B-rakud luuüdis Perifeerne tolerantsus: immunoloogiline ignorantsus, autoreaktiivsete lümfotsüütide anergia või
Seeläbi aktiveerub komplemendisüsteem ja protsessi lisanduvad Fc- retseptorite kaudu mitut liiki rakud. Koekahjustus võib tekkida autoantigeenidest, bakteriaalsetest antigeenidest ja viirusantigeenidest. SLE- immuunkompleksid ladestuvad naha, neeru, liigeste kapillaaridesse ning põhjustavad põletikulise reaktsiooni. Tüüp IV: esinevad autoimmuunhaiguste kui mikrobiaalsete haiguste puhul, kuid on olulised ka transplantaadi hilistes äratõukereaktsioonides. Autoantigeenide või mikrobiaalsete antigeenide suhtes sensibiliseerunud CD4+ T-rakud produtseerivad kudedes tsütokiine, mille tulemusena aktiveeruvad makrofaagid, kujunevad erinevad T-rakkude populatsioonid (Th1, Th17), kahjustuse piirkonda migreerub erinevate omadustega leukotsüüte. Kahjustuse otseseks põhjustajaks on neutrofiilid ja makrofaagid. TBC (tuberkuloos)- kudesid lagundav põletik kopsus. Leepra- nahka ja närvisüsteemi kahjustav nakkushaigus, lööve ja