Ühendid mida kasutatakse: peab teadma Perforiin - 65kD pooride(aukude) 5-20 nm tekitamine, nagu komplemendi reakstioonis tekkinud auk, seal aga tekkes osalevad mitmed eri valgud. + Ca ioonid- polümeriseerumine sarnane komplemendi C9 faktoriga granzymes (fragmentiinid) seriin proteaasid, koos perforiiniga rakku graanulites 1.läbi pooride 2.mannoos 6 fosfaatretseptor - initsieerib DNA tükeldamise 200bp oligomeerideks, Mõlemad rajad viivad apoptoosini. Tapjarakud ei kasuta ainult üht tapmismehhnismi. Mitu korraga. CTL võivad tappa ka Fas ligandi (FasL) abil, seostudes märklaua Fas retseptorile. Viib samuti apoptoosini. Fas ligandilt läheb signaal kaspaaside rajale. Granzymes viib ka läbi kaspaaside apoptoosile. Caspase (cysteine aspartate protease). Kiiresti toimub? Interferoonid, siis NK rakkude maksimum ja viiruse tiiter on maksimaalne viiendal päeval ja viiru spetsiifiliste CTLide maksimum saabub pärast seda.
Fosforüleeritakse tavaliselt seriini, treoniini ja türosiini jääke eukarüootsetes valkudes. Lisaks toimub fosforüleerimine põhilistes aminohappe jääkides histidiinis, arginiis või lüsiinis prokarüootsetes valkudes. Fosfaadi molekuli lisamine polaarsele R rühmale aminohappes võib muuta hüdrofoobse osa polaarseks ja väga hüdrofiilseks, mistõttu toimubki konformatsiooni muutus. Nt p53 tuumorsuppressor valk aktiveerides võib viia apoptoosini. metüleerimine - valgu metüleerimine toimub tavaliselt arginiini või lüsiini jäägi juures. Arginiini saab metüleerida 1 või 2 korda või ühe metüülrühmaga mõlemasse lämmastikku, läbi viivad peptidüülarginiin metüültransferaasid. Lüsiini saab metüleerida 1-3 korda lüsiini metüültransferaaside poolt. Valkude metüleerimist on enim uuritud histoonides, kus seda viivad läbi histoon metüültransferaasid (Met kohal?).