eellasele. Juuritud fülogeneesivõrgul esineb erinevalt split networkist juur. 50. Kuidas konstrueeritakse taandatud mediaanvõrk (reduced median network) (eeltöötlus, võrgu konstrueerimine, võrgu taandamine)? Mediaanvõrgu taandamisel saadud võrk, kus on ebatõenäolised rajad kustutatud. Mediaanvõrgu lihtsustamisel asendatakse eeldatavad homoplaassed tunnused kahe eraldi tunnusega. Saadakse suurem andmemaatriks, mis sisaldab vähem homoplaasiaid. Tunnuse jagamisel võetakse arvesse tunnustele omistatud kaalud ja füogeneesiraja valimisel vastavate haplotüüpide sagedused populatsioonis. 1. Eeltöötlus – andmed viiakse binaarsele kujule, st igat varieeruvat nukleotiidipositsiooni vaadeldakse splitina. (Mittevarieeruvad nukleotiidipositsioonid kustutatakse. Nukleotiidipositsioonid mis toetavad sama splitti, ühendatakse
└──────────────┤ └─────── I 34 Joonis 7. Mono-, para- ja polüfüleetilised rühmad. 35 Lisa 1. Näide klasterdamise kohta: lähimnaabri- (üksiksideme-) klaster dus Andmemaatriks (erinevus OTU-de vahel, standardiseerimata): OTU A B C D E A 0 B 2 0 C 6 5 0 D 10 9 4 0 E 9 8 5 3 0 Kõige sarnasemad (vähemerinevad) üksteisele on A ja B. Ühendame need: ┌───────── B │ └───────── A
annaabi.ee 
