-Defineeritakse alleelidena, millel pole aluskordusmotiivi täpseid kordusi või esinevad kordusmotiivi järjestuse variandid või mõlemad -Võivad esineda insertsioonid, deletsioonid või aluse vahetused -Järjestuse variatsioon võib esineda korduse sees, külgnevas alas või praimeri seondumise saidis -Võib põhjustada PCR ebaõnnestumist, kui polümorfism praimeri saidis - "null alleelid" Null-alleelid: 15 -Alleelid esinevad, kuid ei amplifitseeru nukleotiidi muutuse tõttu praimeri seondumissaidis -Alleelide väljalangemine on probleem, kuna heterosügootne proov määratakse valesti homosüsoodiks (nn valehomosügootsus) -Kaks PCR praimerite komplekti annavad erinevad tulemused -Probleemid andmebaaside kasutamisel -Uute kittide kasutuselevõtule eelnevad ulatuslikud uuringud 5."Stutter" produktid (definitsioon, esinemine, miks probleemsed). -Piigid, mis on peamiselt üks kordus lühemad tõelistest alleelidest (ahela libisemine DNA
DEF: Alleelid, millel pole aluskordusmotiivi täpseid kordusi või esinevad kordusmotiivi järjestuse variandid või mõlemad Võivad esineda insertsioonid, deletsioonid, aluse vahetused Järjestuse variatsioon võib esineda korduse sees, külgnevas alas või praimeriga seondumise alas Võib põhjustada PCR ebaõnnestumist, kuid praimeriga seondumise sait on muteerunud: null-alleelid Alleelid esinevad, kuid ei amplifitseeru nukleotiidi muutuse tõttu praimeri seondumissaidis heterosügootse isiku võib nii vale-homosügootseks määrata kaks PCR praimerite komplekti annavad erinevad tulemused probleemid andmebaaside kasutamisel uute kittide kasutusele võtmisele eelnevad põhjalikud uuringud 5. "Stutter" produktid (definitsioon, esinemine, miks probleemsed). Piigid, mis on tõelistest alleelidest peamiselt 1 kordus lühemad (ahela libisemine DNA sünteesil)
annaabi.ee 
