Selle tulemusena saab evolutsiooni kiirus konkreetses nukleotiidipositsioonis liiniti erineda. 4. Järjestuste aluspaariline koostis on tasakaalus, st kõigi vaadeldavate järjestuste aluspaariline koostis on enam-vähem ühesugune. Kõrvalekalded: 16S rRNA alusel tehtud termofiilsete ja mesofiilsete bakterite puu rühmitab bakterid valesti. LogDet meetod lubab aluspaarilise koostise varieerumist liiniti. 25. Mis on DNA järjestuste evolutsiooniline e geneetiline kaugus ja kuidas seda hinnatakse? Järjestuste geneetiline kaugus mõõdab nende homoloogsete järjestuste erinevust. Järjestuste geneetilist kaugust mõõdetakse neis toimunud asenduste arvuga. Kauguse hinnang = järjestuste võrdlemisel tuvastatud asenduste arv jagatud järjestuse pikkus. 26. Mida tuleb arvestada DNA evolutsiooni mudeli valimisel?
Taimede puhul. Kasutatakse lühendit PTGS/RNAi quelling – sama tähendusega termin Neurospora puhul (maha suruma) dsRNA – kaheahelaline RNA – double stranded – RNAi oluline vahendaja RdRP – RNA sõltuv RNA polümeraas suunab RNA sünteesi RNA matriitsi alusel, mulle tulemuseks on dsRNA. Pole RNAi toimumiseks vajalik kui rakus on suur kogus dsRNA-d RNaas III – dsRNA spetsiifiline endoribonukleaas, mis hüdrolüüsib rohkem kui 10 aluspaarilise dsRNA fosfodiestersidemeid. RNAi puhul toimub pikkade dsRNA-de lagundamine väiksemateks fragmentideks (21-25 aluspaari), mida viivad läbi RNaas III homoloogid, nt Dorsophilas valk nimega Dicer. siRNA – vaigistamist indutseeriv RNA on RNaas III sarnaste ensüümide hüdrolüüsi produkt; 21-25 nukleotiidi pikk, mis on kas „sense“ või „antisense“ järjestusorientatsiooniga. antisense RNA – - mRNA-ga komplementaarne, mis mRNA-ga seondudes moodustab
annaabi.ee 
