LD baastase = 0,35-0,96 5) Mis juhtub aja jooksul LD-ga? Näiteks, LD (D=0.4) kahe 0,03 cM kaugusel paikneva lookuse vahel. Mis juhtub LD-ga peale viit põlvkonda? Mis põhjustab LD muutuse? Peale viit põlvkonda LD läheb 2 korda väiksemaks. LD muutust põhjustab rekombinatsiooni kiirus. 6) Kuidas rekombinatsiooni kiirus on kromosoomidel jaotunud (ühtalset/mitteühtlaselt)? Miks täheldame haplotüübiblokke 1K alsupaari (1000 aluspaari) tasemel ? Rekombinatsiooni kiirus kromosoomidel on jaotunud mitteühtlaselt. Nädal 7. Populatsiooni(de) demograafilise ajaloo rekonstrueerimine 1. Võrdle populatsioonigeneetikas populatsioonide demograafilise ajaloo rekonstrueerimisel kasutatavaid geneetilise struktuuri kirjeldamise ja analüütilisi meetodeid üldiselt. Struktuuri kirjeldavad meetodid ei hinda spetsiifiliselt mingit populatsioonigeneetika mudeli parameetrit
LD korral on võimalik kirjeldada, mil määral on nt kahe lookuse alleelid üksteisega seostunud. 5) Mis juhtub aja jooksul LD-ga? Näiteks, LD (D=0.4) kahe 0,03 cM kaugusel paikneva lookuse vahel. Mis juhtub LD-ga peale viit põlvkonda? Mis põhjustab LD muutuse? DtAB=(1-θ)tD0AB 6) Kuidas rekombinatsiooni kiirus on kromosoomidel jaotunud (ühtalset/mitteühtlaselt)? Miks täheldame haplotüübiblokke 1K alsupaari (1000 aluspaari) tasemel ? Üldiselt on mitmekesisus väiksem seal, kus rekombinatsiooni on vähe- tsentromeerile lähemal ja väikestes kromosoomides. Põhjusteks ongi ilmselt selective sweep-id ja taustavalik. Selective sweep korral toimub kasulik mutatsioon ühes liinis ning valik hakkab soosima just seda haplotüüpi koos lähedal asuvate aheldunud lookustega, mistõttu see üsna kiiresti fikseerub
annaabi.ee 
