Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse
Sulge

"algpopulatsioonide" - 2 õppematerjali

Populatsioonigeneetika eksam
68
doc

Populatsioonigeneetika eksam

6. Kirjelda Structure-sarnaseid meetodeid populatsioonide geneetilise struktuuri hindamisel. Millel need meetodid põhinevad. Mida tuleb tulemusi interpreteerides silmas pidada. Ja mille põhjal saab hinnata segunemise (suhtelist) vanust. Põhinevad ellasseisundi määramisel -päritolukoefitsentide määramisel statistilise mudeli parameetritena. Põhimõte – mudeldatakse populatsioonistruktuuri leidmaks kombinatsioon “algpopulatsioonide” alleelisagedustest ja uuritavate indiviidide “päritolumustrist”, mis maksimaalselt vähendab HWE ja ahelduse (LD) tasakaalutust. ADMIXTURE konstrueerib uurija poolt defineeritud arvu hüpoteetilisi algpopulatsioone ja hindab igale uuringusse kaasatud proovile tõenäosuse millega ta pärineb igast ühest neist hüpoteetilisestest algpopulatsioonidest. 7. Kirjelda Patterson’i D (või ABBA – BABA) testi.

Bioloogia → Geneetika
34 allalaadimist
Populatsioonigeneetika 2014
52
doc

Populatsioonigeneetika 2014

Millel need meetodid põhinevad. Mida tuleb tulemusi interpreteerides silmas pidada. Ja mille põhjal saab hinnata segunemise (suhtelist) vanust. (Helis) Termin tuleb esimesest sellisest analüüsivahendist, mille nimi on STRUCTURE. Mudelil põhinev eellasseisundi määramine – päritolukoefitsentide määramine statistilise mudeli parameetritena (ADMIXTURE, FRAPPE, structure). Põhimõte seisneb selles, et mudeldatakse populatsiooni struktuuri leidmaks kombinatsioon „algpopulatsioonide“ alleelisagedustest ja uuritavate indiviidide „päritolumustrist“, mis maksimaalselt vähendab HWE ja ahelduse (LD) tasakaalutust. Oluline on, et „eellaspopulatsioon“, mida rekonstrueeritakse, ei ole reaalne, kunagi eksisteerinud populatsioon formaalses mõttes. Tegelikult struktureeritakse vaid tänapäevast geneetilist varieeruvust. Nüüdseks on väga populaarne ADMIXTURE, sest see on kiire. Konstrueerib uurija poolt defineeritud arvu

Bioloogia → Bioloogia
6 allalaadimist


Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun