Põhinevad ellasseisundi määramisel -päritolukoefitsentide määramisel statistilise mudeli parameetritena. Põhimõte – mudeldatakse populatsioonistruktuuri leidmaks kombinatsioon “algpopulatsioonide” alleelisagedustest ja uuritavate indiviidide “päritolumustrist”, mis maksimaalselt vähendab HWE ja ahelduse (LD) tasakaalutust. ADMIXTURE konstrueerib uurija poolt defineeritud arvu hüpoteetilisi algpopulatsioone ja hindab igale uuringusse kaasatud proovile tõenäosuse millega ta pärineb igast ühest neist hüpoteetilisestest algpopulatsioonidest. 7. Kirjelda Patterson’i D (või ABBA – BABA) testi. Kasutame välisgrupi genoomi, et määrata eelasseisund igas genoomi positsioonis. Seejärel loeme kokku mitmes positsioonis jagab testgenoom sama nukleotiidi populatsiooniga A või B. Saame teada kummaga on testpopulatsioon sarnasem. 8
„algpopulatsioonide“ alleelisagedustest ja uuritavate indiviidide „päritolumustrist“, mis maksimaalselt vähendab HWE ja ahelduse (LD) tasakaalutust. Oluline on, et „eellaspopulatsioon“, mida rekonstrueeritakse, ei ole reaalne, kunagi eksisteerinud populatsioon formaalses mõttes. Tegelikult struktureeritakse vaid tänapäevast geneetilist varieeruvust. Nüüdseks on väga populaarne ADMIXTURE, sest see on kiire. Konstrueerib uurija poolt defineeritud arvu hüpoteetilisi algpopulatsioone (k) ja hindab igale uuringusse kaasatud proovile tõenäosuse, millega ta pärineb igast ühest neist hüpoteetilistest algpopulatsioonidest. Visualiseerimine toimub tulpdiagrammina, iga indiviidi kohta üks tulp. Tavaliselt sooritatakse analüüs läbi paljude k väärtustega, et jälgida struktuuri muutumist läbi erinevate k väärtuste. Selle struktuuri hierarhilisuses sisaldub ka fülogeneetiline info, kuid kahjuks mitte ainult.
annaabi.ee 
