Lõplik samastamine toimub kas kommertsiaalse Vitek 2 süsteemi või MALDI-TOF abil (vt.üldosa praktikum); tüpiseerimiseks saadetakse isolaadid Eesti Tervisekaitse laboratooriumi. ENTEROPATOGEENSE E. coli VIRULENTSUSMARKERITE MÄÄRAMINE • ETEC – määratakse võime toota termostabiilset (ST) ja termolabiilset (LT) enterotoksiini, kasutades ELISA-t, lateksaglutinatsioonireaktsiooni või DNA teste • EPEC – määratakse O ja H antigeenne struktuur, otsitakse aglutinatsioonireaktsiooni abil teadaolevaid enteropatogeenseid serogruppe – O55, O111:H2 jt., kasutades selleks vastavaid polü- ja monovalentseid seerumeid • EIEC – invasioonivõime määramiseks HEp-2 ja HeLa rakukultuuridel, O ja H serotüpeerimine, ELISA • EHEC – otsitakse aglutinatsioonireaktsiooni abil teadaolevaid enterohemorraagilisi, verotoksiini produtseerivaid serotüüpe – peamiselt serotüüpi O157:H7, aga ka O26:H11, O111. NB! Mitte kõik
mõlema homosügoodi geeni alleelid võrdselt (muidu avaldub dominantne). NÄIDE: Inimese vererakud võivad toota M ja N antigeeni korraga. Inimestel esineb selline olukord vererakkude M- ja N-antigeenide äratundmisel. Neid inimese immuunsüsteemi poolt toodetavaid antigeene, määratakse sama geeni kahe erisuguse alleelse variandi poolt. M- ja N-veregruppidega homosügoote (AA) saab veretüüpide detekteerimisel selgitada vastavalt anti-M ja anti-N seerumitega (antikehadega), mis annavad aglutinatsioonireaktsiooni (antigeen+antikeha=sade). Heterosügootidel (Aa) esineb aga reaktsioon mõlema antiseerumiga, see tähendab, et mõlemad alleelid avalduvad teineteisest tõltumatult. Nt inimestel on veres kaks antigeeni L ja M. 6 NÄIDE: Rodotendronil võivad olla siiru-viirulised õied. Mõlemad alleelid võivad avalduda. MITMEALLEELSUS=POLÜALLEELSUS - Tunnuse määravad ühe geeni 3 või enam alleeli. Geen võib esineda rohkem kui kahe erisuguse alleelina.