"wunschi" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika ülesanded

Lys(K) -5 -3 -4 -3 0 Ile(I) -3 -3 -4 -3 -4 0 Selgitus: Ala on 0. Tuleb lugeda, mitu ringi on vaja läbida mingisuguse teise aminohappeni jõudmiseks. Ala tuleb lahutada ringist kõik ülejäänud ringid, mida on vaja läbida 5. Leidke käsitsi kahe järjestuse optimaalne globaalne joondamine Needleman-Wunschi algoritmi järgi ­ kokkulangevus = +1, mittekokkulangevus = 0, tühik = -1. ACAGTCGAACG ACCGTCCG Vastus: M=11 N=8 A C A G T C G A A C G 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6 -7 -8 -9 -10 -11 A -1 1 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6 -7 -8 -9